RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM78Q5T7P6 136 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 KLK15Q9H2R5 256 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 RPRMQ9NS64 109 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-201ENST00000348564 UPK2O00526 184 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 DFFBO76075 338 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 PSMB6P28072 239 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 DUTP33316 252 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 PPT1P50897 306 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 AANATQ16613 207 aa3.52□□□□□ -1.85
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PTPRC-201ENST00000348564 CYYR1Q96J86 154 aa3.52□□□□□ -1.85
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PTPRC-201ENST00000348564 GPX1P07203 203 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
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PTPRC-201ENST00000348564 OR51G1Q8NGK1 321 aa3.52□□□□□ -1.85
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PTPRC-201ENST00000348564 FAM110AQ9BQ89 295 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 NEURL2Q9BR09 285 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 CABLES2Q9BTV7 478 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 MEGF9Q9H1U4 602 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 FAM223BA6NKX1 122 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 G3V4G9 280 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFB8O95169 186 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 SIX6O95475 246 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
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PTPRC-201ENST00000348564 CD83Q01151 205 aa3.52□□□□□ -1.85
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF415Q09FC8 603 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 NHLRC3Q5JS37 347 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 FAM78BQ5VT40 261 aa3.52□□□□□ -1.85
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PTPRC-201ENST00000348564 SEC22CQ9BRL7 303 aa3.52□□□□□ -1.85
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PTPRC-201ENST00000348564 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa3.51□□□□□ -1.85
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PTPRC-201ENST00000348564 DEFB135Q30KP9 77 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 TIGITQ495A1 244 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 C10orf113Q5VZT2 155 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 LYZL2Q7Z4W2 148 aa3.51□□□□□ -1.85
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PTPRC-201ENST00000348564 RNF183Q96D59 192 aa3.51□□□□□ -1.85
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PTPRC-201ENST00000348564 COL12A1Q99715 3063 aa3.51□□□□□ -1.85
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PTPRC-201ENST00000348564 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa3.51□□□□□ -1.85
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PTPRC-201ENST00000348564 SAMD13Q5VXD3 122 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 C10orf99Q6UWK7 81 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 DEDD2Q8WXF8 326 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 RAB40CQ96S21 281 aa3.51□□□□□ -1.85
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PTPRC-201ENST00000348564 HMGN3Q15651 99 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 PRR27Q6MZM9 219 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 AKAP14Q86UN6 197 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 OR9G4Q8NGQ1 327 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 C9JCJ5 164 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-201ENST00000348564 DEFB4AO15263 64 aa3.51□□□□□ -1.85
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