RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 TTC32Q5I0X7 151 aa9.88□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa9.88□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 DTX2Q86UW9 622 aa9.88□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 CHAC2Q8WUX2 184 aa9.88□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa9.88□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 EFNA4P52798 201 aa9.87□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa9.87□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF414Q96IQ9 312 aa9.87□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa9.87□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 IQCF6A8MYZ5 107 aa9.87□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM200BQ69YZ2 307 aa9.87□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 ST20Q9HBF5 79 aa9.87□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 RND3P61587 244 aa9.87□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa9.87□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 C5orf24Q7Z6I8 188 aa9.87□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 C14orf144Q96I85 54 aa9.87□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 PRADC1Q9BSG0 188 aa9.87□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 COL6A6A6NMZ7 2263 aa9.87□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa9.87□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 F5H768 121 aa9.87□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A087WV48 116 aa9.87□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 TRAV5A0A0B4J249 113 aa9.87□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM249Q2WGJ8 235 aa9.86□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC01356Q8N9X3 169 aa9.86□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 FANCMQ8IYD8 2048 aa9.86□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 SYNJ2BPP57105 145 aa9.86□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa9.86□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 NPIPB13A6NJU9 1138 aa9.86□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 NPIPB5A8MRT5 1133 aa9.86□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 B4DSR2 109 aa9.86□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 FOLR2P14207 255 aa9.86□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 GATD1Q8NB37 220 aa9.86□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 K7ERU9 68 aa9.86□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 COX19Q49B96 90 aa9.86□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC25A38Q96DW6 304 aa9.86□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 CACNA1BQ00975 2339 aa9.86□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 IGHMP01871 453 aa9.86□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 RAG2P55895 527 aa9.86□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 LYPD2Q6UXB3 125 aa9.86□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 PAX1P15863 534 aa9.85□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 CTHRC1Q96CG8 243 aa9.85□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 DOCK8Q8NF50 2099 aa9.85□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 RNF125Q96EQ8 232 aa9.85□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 SMIM8Q96KF7 97 aa9.85□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM250H0YL14 139 aa9.85□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 MORN2Q502X0 79 aa9.85□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 GREB1Q4ZG55 1949 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00299Q6ZSB3 139 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 HBDP02042 147 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 GATAD1Q8WUU5 269 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNRD1Q9P1U0 126 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 COL4A6Q14031 1691 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 OR11H12B2RN74 326 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00205P59089 165 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 C10orf126Q8N4M7 172 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM169BQ8N8A8 192 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 OR11H1Q8NG94 326 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 OR11H2Q8NH07 326 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 SDK2Q58EX2 2172 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 IRF3Q14653 427 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM8BA6NDV4 472 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 IGLV2-23P01705 113 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 HLA-DQA1P01909 254 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 TCF23Q7RTU1 214 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 M0QZK8 103 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 CA1P00915 261 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00614P0C842 121 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 DSCR9P59020 149 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 LYZL4Q96KX0 146 aa9.84□□□□□ -0.83
UBASH3B-201ENST00000284273 PTPRFP10586 1907 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-201ENST00000284273 KNCNA6PVL3 124 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-201ENST00000284273 OR9G9P0C7N8 305 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-201ENST00000284273 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-201ENST00000284273 XCL2Q9UBD3 114 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-201ENST00000284273 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM90A10PA6NDY2 464 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM90A18PA6NE21 464 aa9.83□□□□□ -0.84
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM90A16PA6NEW6 464 aa9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.8 ms