RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025804.5

Rab1b-201, Transcript of Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rab1b, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rab32Q9CZE3 223 aa14.8□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rnf115Q9D0C1 305 aa14.8□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Tex36Q9D5N9 219 aa14.8□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 MthfrQ9WU20 654 aa14.8□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Slc22a5Q9Z0E8 557 aa14.8□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr243E9PV96 316 aa14.79□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr432E9Q8M2 312 aa14.79□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr1406E9Q8X1 310 aa14.79□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 H2-M10.1O19443 331 aa14.79□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Serf1O88892 62 aa14.79□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Igsf11P0C673 428 aa14.79□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 C5ar1P30993 351 aa14.79□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr1384Q8VFA8 318 aa14.79□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Tmem219Q9D123 240 aa14.79□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Vstm5Q9D806 199 aa14.79□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rcl1Q9JJT0 373 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr157Q9QZ20 318 aa14.79□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Eif5aP63242 154 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Nr2c2apQ3TV70 140 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Slc38a11Q3USY0 453 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 A3galt2Q3V1N9 370 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Tmem106bQ80X71 275 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Stpg2Q8C8J0 561 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 MpiQ924M7 423 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Lnp1A0A1B0GSK3 178 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr1289A0A288CFY5 326 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 RnlsA7RDN6 342 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Nxph4G3X9N5 304 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Wnt2bO70283 389 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 PrkacaP05132 351 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Zdhhc23Q5Y5T3 425 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Zic4Q61467 341 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr1170Q8VFG1 316 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Fbxo36Q9CQ24 188 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 GmfbQ9CQI3 142 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Klk1b27Q9JM71 263 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Dctn5Q9QZB9 182 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Cldn15Q9Z0S5 227 aa14.78□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 TncQ80YX1 2110 aa14.77□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Zfp982A2A8Q4 368 aa14.77□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm10073E9Q3T0 114 aa14.77□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 MyadmO35682 320 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr143P34985 313 aa14.77□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Neurog3P70661 214 aa14.77□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm813Q3UWK9 176 aa14.77□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Mindy2Q6PDI6 601 aa14.77□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ceacam9Q78T27 234 aa14.77□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Tmem204Q7TQI0 226 aa14.77□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Atpaf1Q811I0 324 aa14.77□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rbm14Q8C2Q3 669 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Nol3Q9D1X0 220 aa14.77□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Sh2d6Q9D413 297 aa14.77□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 CutcQ9D8X1 272 aa14.77□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Suv39h2Q9EQQ0 477 aa14.77□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Mast4Q811L6 2618 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Nav2E9Q842 2432 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ldlrad3A2AR95 345 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm45692D3Z0A0 150 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Cln6Q3U466 308 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Wfdc9Q3UW41 83 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr1465Q7TQR2 307 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Inpp5kQ8C5L6 468 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Fn3krpQ8K274 309 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Armc10Q9D0L7 306 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 4931428L18RikQ9D4S9 127 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Tmbim7Q9D592 302 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Sp5Q9JHX2 398 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Tep1P97499 2629 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Tmem116A0A0G2JGD3 401 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ino80eA0A0U1RP99 260 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr587-ps1A0A1B0GSS1 159 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr102B2RT33 308 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr635K7N6B1 321 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Sdc1P18828 311 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rpl12P35979 165 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Pax5Q02650 391 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Lhfpl5Q4KL25 219 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rnase12Q5GAM8 145 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Xaf1Q5NBU8 273 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Slc22a27Q76M72 551 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Zfp799Q8BHK4 648 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 LaynQ8C351 381 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr101Q920Z0 308 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Arpc5Q9CPW4 151 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ccl8Q9Z121 97 aa14.76□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm4884E9PVP9 694 aa14.75□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Npffr1E9Q468 432 aa14.75□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm6526G3X9Q9 198 aa14.75□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Tnfrsf1aP25118 454 aa14.75□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Dvl1P51141 695 aa14.75□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Lsm5P62322 91 aa14.75□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr504Q7TRU7 318 aa14.75□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Q80VP5 184 aa14.75□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 C730034F03RikQ8BGL5 111 aa14.75□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Slc25a41Q8BVN7 312 aa14.75□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Smim4Q8C1Q6 80 aa14.75□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rbm48Q8K2X2 371 aa14.75□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr1408Q8VG32 310 aa14.75□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Snx18Q91ZR2 614 aa14.75□□□□□ -0.05
Rab1b-201ENSMUST00000025804 PpifQ99KR7 206 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 51.5 ms