Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP99

Ino80e, INO80 complex subunit E (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80eA0A0U1RP99 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ino80eA0A0U1RP99 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ino80eA0A0U1RP99 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ino80eA0A0U1RP99 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ino80eA0A0U1RP99 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ino80eA0A0U1RP99 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ino80eA0A0U1RP99 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ino80eA0A0U1RP99 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ino80eA0A0U1RP99 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ino80eA0A0U1RP99 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ino80eA0A0U1RP99 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ino80eA0A0U1RP99 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ino80eA0A0U1RP99 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ino80eA0A0U1RP99 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ino80eA0A0U1RP99 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ino80eA0A0U1RP99 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ino80eA0A0U1RP99 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ino80eA0A0U1RP99 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ino80eA0A0U1RP99 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ino80eA0A0U1RP99 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ino80eA0A0U1RP99 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ino80eA0A0U1RP99 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ino80eA0A0U1RP99 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ino80eA0A0U1RP99 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ino80eA0A0U1RP99 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ino80eA0A0U1RP99 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80eA0A0U1RP99 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ino80eA0A0U1RP99 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ino80eA0A0U1RP99 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ino80eA0A0U1RP99 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ino80eA0A0U1RP99 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ino80eA0A0U1RP99 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ino80eA0A0U1RP99 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ino80eA0A0U1RP99 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ino80eA0A0U1RP99 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ino80eA0A0U1RP99 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ino80eA0A0U1RP99 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ino80eA0A0U1RP99 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ino80eA0A0U1RP99 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ino80eA0A0U1RP99 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ino80eA0A0U1RP99 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ino80eA0A0U1RP99 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ino80eA0A0U1RP99 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ino80eA0A0U1RP99 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ino80eA0A0U1RP99 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ino80eA0A0U1RP99 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ino80eA0A0U1RP99 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ino80eA0A0U1RP99 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ino80eA0A0U1RP99 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ino80eA0A0U1RP99 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ino80eA0A0U1RP99 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ino80eA0A0U1RP99 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ino80eA0A0U1RP99 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ino80eA0A0U1RP99 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ino80eA0A0U1RP99 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ino80eA0A0U1RP99 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ino80eA0A0U1RP99 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ino80eA0A0U1RP99 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ino80eA0A0U1RP99 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ino80eA0A0U1RP99 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ino80eA0A0U1RP99 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ino80eA0A0U1RP99 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ino80eA0A0U1RP99 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ino80eA0A0U1RP99 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ino80eA0A0U1RP99 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ino80eA0A0U1RP99 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ino80eA0A0U1RP99 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80eA0A0U1RP99 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ino80eA0A0U1RP99 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ino80eA0A0U1RP99 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ino80eA0A0U1RP99 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80eA0A0U1RP99 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ino80eA0A0U1RP99 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ino80eA0A0U1RP99 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ino80eA0A0U1RP99 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ino80eA0A0U1RP99 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ino80eA0A0U1RP99 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80eA0A0U1RP99 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ino80eA0A0U1RP99 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ino80eA0A0U1RP99 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ino80eA0A0U1RP99 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80eA0A0U1RP99 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80eA0A0U1RP99 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80eA0A0U1RP99 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ino80eA0A0U1RP99 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ino80eA0A0U1RP99 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ino80eA0A0U1RP99 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ino80eA0A0U1RP99 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ino80eA0A0U1RP99 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ino80eA0A0U1RP99 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80eA0A0U1RP99 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80eA0A0U1RP99 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ino80eA0A0U1RP99 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ino80eA0A0U1RP99 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ino80eA0A0U1RP99 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ino80eA0A0U1RP99 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ino80eA0A0U1RP99 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms