Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI6

Mindy2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-2, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy2Q6PDI6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Mindy2Q6PDI6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Mindy2Q6PDI6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Mindy2Q6PDI6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mindy2Q6PDI6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Mindy2Q6PDI6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mindy2Q6PDI6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mindy2Q6PDI6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Mindy2Q6PDI6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mindy2Q6PDI6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mindy2Q6PDI6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mindy2Q6PDI6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mindy2Q6PDI6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mindy2Q6PDI6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Mindy2Q6PDI6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mindy2Q6PDI6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mindy2Q6PDI6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Mindy2Q6PDI6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Mindy2Q6PDI6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Mindy2Q6PDI6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Mindy2Q6PDI6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Mindy2Q6PDI6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mindy2Q6PDI6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mindy2Q6PDI6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mindy2Q6PDI6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mindy2Q6PDI6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Mindy2Q6PDI6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mindy2Q6PDI6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mindy2Q6PDI6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Mindy2Q6PDI6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mindy2Q6PDI6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mindy2Q6PDI6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mindy2Q6PDI6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mindy2Q6PDI6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mindy2Q6PDI6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mindy2Q6PDI6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mindy2Q6PDI6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Mindy2Q6PDI6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mindy2Q6PDI6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mindy2Q6PDI6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Mindy2Q6PDI6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mindy2Q6PDI6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mindy2Q6PDI6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mindy2Q6PDI6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mindy2Q6PDI6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mindy2Q6PDI6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mindy2Q6PDI6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mindy2Q6PDI6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mindy2Q6PDI6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mindy2Q6PDI6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mindy2Q6PDI6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mindy2Q6PDI6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mindy2Q6PDI6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mindy2Q6PDI6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mindy2Q6PDI6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mindy2Q6PDI6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mindy2Q6PDI6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mindy2Q6PDI6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Mindy2Q6PDI6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mindy2Q6PDI6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Mindy2Q6PDI6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mindy2Q6PDI6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mindy2Q6PDI6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mindy2Q6PDI6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mindy2Q6PDI6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mindy2Q6PDI6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mindy2Q6PDI6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mindy2Q6PDI6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mindy2Q6PDI6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mindy2Q6PDI6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mindy2Q6PDI6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mindy2Q6PDI6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Mindy2Q6PDI6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mindy2Q6PDI6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mindy2Q6PDI6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mindy2Q6PDI6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mindy2Q6PDI6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mindy2Q6PDI6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mindy2Q6PDI6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mindy2Q6PDI6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mindy2Q6PDI6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mindy2Q6PDI6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Mindy2Q6PDI6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mindy2Q6PDI6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mindy2Q6PDI6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mindy2Q6PDI6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mindy2Q6PDI6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mindy2Q6PDI6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mindy2Q6PDI6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mindy2Q6PDI6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mindy2Q6PDI6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mindy2Q6PDI6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mindy2Q6PDI6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mindy2Q6PDI6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mindy2Q6PDI6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mindy2Q6PDI6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mindy2Q6PDI6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mindy2Q6PDI6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mindy2Q6PDI6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mindy2Q6PDI6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms