Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Nol3Q9D1X0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nol3Q9D1X0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nol3Q9D1X0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nol3Q9D1X0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nol3Q9D1X0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nol3Q9D1X0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nol3Q9D1X0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Nol3Q9D1X0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Nol3Q9D1X0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Nol3Q9D1X0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nol3Q9D1X0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Nol3Q9D1X0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nol3Q9D1X0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nol3Q9D1X0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nol3Q9D1X0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nol3Q9D1X0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Nol3Q9D1X0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nol3Q9D1X0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nol3Q9D1X0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nol3Q9D1X0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nol3Q9D1X0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nol3Q9D1X0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nol3Q9D1X0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nol3Q9D1X0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nol3Q9D1X0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nol3Q9D1X0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nol3Q9D1X0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nol3Q9D1X0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nol3Q9D1X0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nol3Q9D1X0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nol3Q9D1X0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nol3Q9D1X0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nol3Q9D1X0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nol3Q9D1X0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nol3Q9D1X0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nol3Q9D1X0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nol3Q9D1X0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Nol3Q9D1X0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nol3Q9D1X0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nol3Q9D1X0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nol3Q9D1X0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nol3Q9D1X0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nol3Q9D1X0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nol3Q9D1X0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nol3Q9D1X0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nol3Q9D1X0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nol3Q9D1X0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nol3Q9D1X0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nol3Q9D1X0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nol3Q9D1X0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nol3Q9D1X0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nol3Q9D1X0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nol3Q9D1X0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nol3Q9D1X0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nol3Q9D1X0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nol3Q9D1X0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nol3Q9D1X0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nol3Q9D1X0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nol3Q9D1X0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nol3Q9D1X0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nol3Q9D1X0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nol3Q9D1X0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nol3Q9D1X0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nol3Q9D1X0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nol3Q9D1X0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nol3Q9D1X0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nol3Q9D1X0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nol3Q9D1X0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nol3Q9D1X0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nol3Q9D1X0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nol3Q9D1X0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nol3Q9D1X0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nol3Q9D1X0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nol3Q9D1X0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nol3Q9D1X0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nol3Q9D1X0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nol3Q9D1X0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nol3Q9D1X0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nol3Q9D1X0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nol3Q9D1X0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nol3Q9D1X0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nol3Q9D1X0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Nol3Q9D1X0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nol3Q9D1X0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nol3Q9D1X0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nol3Q9D1X0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nol3Q9D1X0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nol3Q9D1X0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nol3Q9D1X0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nol3Q9D1X0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nol3Q9D1X0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nol3Q9D1X0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nol3Q9D1X0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nol3Q9D1X0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nol3Q9D1X0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nol3Q9D1X0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nol3Q9D1X0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nol3Q9D1X0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nol3Q9D1X0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms