Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Snx18Q91ZR2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Snx18Q91ZR2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Snx18Q91ZR2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snx18Q91ZR2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Snx18Q91ZR2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Snx18Q91ZR2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Snx18Q91ZR2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Snx18Q91ZR2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Snx18Q91ZR2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Snx18Q91ZR2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Snx18Q91ZR2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Snx18Q91ZR2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Snx18Q91ZR2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Snx18Q91ZR2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Snx18Q91ZR2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Snx18Q91ZR2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx18Q91ZR2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx18Q91ZR2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx18Q91ZR2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx18Q91ZR2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx18Q91ZR2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx18Q91ZR2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx18Q91ZR2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx18Q91ZR2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx18Q91ZR2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx18Q91ZR2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Snx18Q91ZR2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx18Q91ZR2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx18Q91ZR2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx18Q91ZR2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx18Q91ZR2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx18Q91ZR2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx18Q91ZR2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx18Q91ZR2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx18Q91ZR2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx18Q91ZR2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx18Q91ZR2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Snx18Q91ZR2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Snx18Q91ZR2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Snx18Q91ZR2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Snx18Q91ZR2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Snx18Q91ZR2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Snx18Q91ZR2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx18Q91ZR2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx18Q91ZR2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx18Q91ZR2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx18Q91ZR2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx18Q91ZR2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx18Q91ZR2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx18Q91ZR2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx18Q91ZR2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx18Q91ZR2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx18Q91ZR2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx18Q91ZR2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx18Q91ZR2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx18Q91ZR2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx18Q91ZR2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx18Q91ZR2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx18Q91ZR2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snx18Q91ZR2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snx18Q91ZR2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snx18Q91ZR2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snx18Q91ZR2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snx18Q91ZR2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snx18Q91ZR2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snx18Q91ZR2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Snx18Q91ZR2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Snx18Q91ZR2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx18Q91ZR2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snx18Q91ZR2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snx18Q91ZR2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx18Q91ZR2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx18Q91ZR2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx18Q91ZR2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx18Q91ZR2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx18Q91ZR2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx18Q91ZR2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx18Q91ZR2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx18Q91ZR2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx18Q91ZR2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx18Q91ZR2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx18Q91ZR2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx18Q91ZR2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx18Q91ZR2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx18Q91ZR2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx18Q91ZR2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx18Q91ZR2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx18Q91ZR2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Snx18Q91ZR2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Snx18Q91ZR2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Snx18Q91ZR2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snx18Q91ZR2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx18Q91ZR2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snx18Q91ZR2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx18Q91ZR2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snx18Q91ZR2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snx18Q91ZR2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx18Q91ZR2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx18Q91ZR2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms