Protein–RNA interactions for Protein: E9Q468

Npffr1, Neuropeptide FF receptor 1, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npffr1E9Q468 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Npffr1E9Q468 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Npffr1E9Q468 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Npffr1E9Q468 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Npffr1E9Q468 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Npffr1E9Q468 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Npffr1E9Q468 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Npffr1E9Q468 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Npffr1E9Q468 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Npffr1E9Q468 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Npffr1E9Q468 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Npffr1E9Q468 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Npffr1E9Q468 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Npffr1E9Q468 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Npffr1E9Q468 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Npffr1E9Q468 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Npffr1E9Q468 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Npffr1E9Q468 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Npffr1E9Q468 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Npffr1E9Q468 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Npffr1E9Q468 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Npffr1E9Q468 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Npffr1E9Q468 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Npffr1E9Q468 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Npffr1E9Q468 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Npffr1E9Q468 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Npffr1E9Q468 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Npffr1E9Q468 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Npffr1E9Q468 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Npffr1E9Q468 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Npffr1E9Q468 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Npffr1E9Q468 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Npffr1E9Q468 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Npffr1E9Q468 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Npffr1E9Q468 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Npffr1E9Q468 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Npffr1E9Q468 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Npffr1E9Q468 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Npffr1E9Q468 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Npffr1E9Q468 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Npffr1E9Q468 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Npffr1E9Q468 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Npffr1E9Q468 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Npffr1E9Q468 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Npffr1E9Q468 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Npffr1E9Q468 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npffr1E9Q468 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npffr1E9Q468 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npffr1E9Q468 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Npffr1E9Q468 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Npffr1E9Q468 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Npffr1E9Q468 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Npffr1E9Q468 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Npffr1E9Q468 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Npffr1E9Q468 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Npffr1E9Q468 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Npffr1E9Q468 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Npffr1E9Q468 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Npffr1E9Q468 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Npffr1E9Q468 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Npffr1E9Q468 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Npffr1E9Q468 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Npffr1E9Q468 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Npffr1E9Q468 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Npffr1E9Q468 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Npffr1E9Q468 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npffr1E9Q468 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npffr1E9Q468 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npffr1E9Q468 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Npffr1E9Q468 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npffr1E9Q468 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npffr1E9Q468 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npffr1E9Q468 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npffr1E9Q468 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Npffr1E9Q468 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npffr1E9Q468 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npffr1E9Q468 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npffr1E9Q468 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Npffr1E9Q468 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Npffr1E9Q468 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npffr1E9Q468 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npffr1E9Q468 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npffr1E9Q468 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npffr1E9Q468 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npffr1E9Q468 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Npffr1E9Q468 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Npffr1E9Q468 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Npffr1E9Q468 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Npffr1E9Q468 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Npffr1E9Q468 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Npffr1E9Q468 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Npffr1E9Q468 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Npffr1E9Q468 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Npffr1E9Q468 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Npffr1E9Q468 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Npffr1E9Q468 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Npffr1E9Q468 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Npffr1E9Q468 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Npffr1E9Q468 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Npffr1E9Q468 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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