RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527718.1

PABPC4-222, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 4, human

TSL 5

Gene PABPC4, Length 746 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC4-222	ENST00000527718	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	STAG3L3	P0CL85	134 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	LYNX1	P0DP58	116 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	DEFA5	Q01523	94 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	CDSN	Q15517	529 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	TNXA	Q16473	311 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	PRSS8	Q16651	343 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	PET117	Q6UWS5	81 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	NPB	Q8NG41	125 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	C5orf30	Q96GV9	206 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	CYYR1	Q96J86	154 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	UHRF2	Q96PU4	802 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	VAX2	Q9UIW0	290 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	C15orf62	A8K5M9	175 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	C22orf46	C9J442	243 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718		F6UZH7	168 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	CA2	P00918	260 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	CD5	P06127	495 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	OR13C7	P0DN81	318 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	NPBWR1	P48145	328 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	REG1B	P48304	166 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	LCN2	P80188	198 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	PAX2	Q02962	417 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	CD69	Q07108	199 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6	1e-7	■□□□□ 8.5
PABPC4-222	ENST00000527718	PSG5	Q15238	335 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	RHEB	Q15382	184 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	GATAD1	Q8WUU5	269 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	WFDC1	Q9HC57	220 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	RELN	P78509	3460 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	ZFP92	A6NM28	416 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718		H0Y8G0	127 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	TMEM250	H0YL14	139 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	LY6L	H3BQJ8	138 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	C19orf84	I3L1E1	186 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	TIMM23	O14925	209 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	NPFF	O15130	113 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	VENTX	O95231	258 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	SCGB1D1	O95968	90 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	IGKV1D-33	P01593	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	IGKV1-33	P01594	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	IGHV4-39	P01824	125 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	PF4	P02776	101 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	MSMB	P08118	114 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	SFTA3	P0C7M3	94 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	BCL2	P10415	239 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	RAB9A	P51151	201 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	GNB1	P62873	340 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	BSX	Q3C1V8	233 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	REG4	Q9BYZ8	158 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	SIRPD	Q9H106	197 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC4-222	ENST00000527718	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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