RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 NAP1L6A6NFF2 107 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 FOLR2P14207 255 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 MFAP4P55083 255 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 SPCS3P61009 180 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 Q6ZRM9 215 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 LGI3Q8N145 548 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 OR52E5Q8NH55 327 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 UFC1Q9Y3C8 167 aa11.2□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A0B4J2A0 478 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 CENPXA8MT69 81 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 CORTO00230 105 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 MT-CO2P00403 227 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 SULT1A3P0DMM9 295 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 SULT1A4P0DMN0 295 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 ELLP55199 621 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 BAK1Q16611 211 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 AARDQ4LEZ3 155 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 GTSCR1Q86UQ5 136 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 MARC2Q969Z3 335 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 GPR146Q96CH1 333 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 TXN2Q99757 166 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 SHPKQ9UHJ6 478 aa11.19□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM213A2RRL7 107 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 CEBPZOSA8MTT3 80 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 I3L2K1 104 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 NDUFA4O00483 81 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 CBLN1P23435 193 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 VAMP1P23763 118 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 RELQ04864 619 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 CENPSQ8N2Z9 138 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 PRR13Q9NZ81 148 aa11.18□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 COL7A1Q02388 2944 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 F8W735 103 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 GNG7O60262 68 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 HTR2BP41595 481 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 CCR6P51684 374 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 SMCO1Q147U7 214 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 DEFB114Q30KQ6 69 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 UXS1Q8NBZ7 420 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 DUSP18Q8NEJ0 188 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 CACNG8Q8WXS5 425 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM190Q8WZ59 177 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 CHRDL1Q9BU40 450 aa11.17□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 IZUMO1RA6ND01 250 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 IL7P13232 177 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 ADMP35318 185 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 NPBWR1P48145 328 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 TM4SF20Q53R12 229 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 NMSQ5H8A3 153 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 LYZL2Q7Z4W2 148 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 HIPK2Q9H2X6 1198 aa11.16□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 SCGB2A1O75556 95 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 NDUFB6O95139 128 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 SFT2D2O95562 160 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 IGHV3-48P01763 117 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 CTSGP08311 255 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 EDN2P20800 178 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 OPRK1P41145 380 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 PPP1R1AQ13522 171 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 GUCA2BQ16661 112 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 BSXQ3C1V8 233 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 PVRIGQ6DKI7 326 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 NOXA1Q86UR1 476 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 Q8N1Y9 231 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 OR1S1Q8NH92 325 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 C20orf24Q9BUV8 137 aa11.15□□□□□ -0.62
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A1B0GU03 582 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP1-205ENST00000466097 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP1-205ENST00000466097 NXPH3O95157 252 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP1-205ENST00000466097 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP1-205ENST00000466097 C8orf88P0DMB2 117 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP1-205ENST00000466097 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP1-205ENST00000466097 TNFRSF9Q07011 255 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP1-205ENST00000466097 BTNL8Q6UX41 500 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC00299Q6ZSB3 139 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP1-205ENST00000466097 LRTM2Q8N967 370 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP1-205ENST00000466097 SLC24A4Q8NFF2 622 aa11.14□□□□□ -0.63
SH3BP1-205ENST00000466097 MLXQ9UH92 298 aa11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms