RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 S100PP25815 95 aa13.39□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GCHFRP30047 84 aa13.39□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GALR1P47211 349 aa13.39□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 REG1BP48304 166 aa13.39□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CASP6P55212 293 aa13.39□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NDUFA6P56556 154 aa13.39□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LINC01551Q86U37 167 aa13.39□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR5B12Q96R08 314 aa13.39□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COMMD5Q9GZQ3 224 aa13.39□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SRD5A3Q9H8P0 318 aa13.39□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa13.38□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NDUFB4O95168 129 aa13.38□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRGC1P0CF51 173 aa13.38□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGHV1-8P0DP01 117 aa13.38□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CD99P14209 185 aa13.38□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CHRNB4P30926 498 aa13.38□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CA7P43166 264 aa13.38□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 S100A12P80511 92 aa13.38□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CD69Q07108 199 aa13.38□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa13.38□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C11orf42Q8N5U0 333 aa13.38□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC35E1Q96K37 410 aa13.38□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WASHC3Q9Y3C0 194 aa13.38□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa13.37□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MT-CO2P00403 227 aa13.37□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UCNP55089 124 aa13.37□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ERHP84090 104 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GAMTQ14353 236 aa13.37□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa13.37□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR10W1Q8NGF6 305 aa13.37□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FRZBQ92765 325 aa13.37□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM204Q9BSN7 226 aa13.37□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 A0A1W2PN81 502 aa13.36□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FSTL3O95633 263 aa13.36□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLAUP00749 431 aa13.36□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IGLV2-23P01705 113 aa13.36□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CHRNA7P36544 502 aa13.36□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SRP14P37108 136 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC16A13Q7RTY0 426 aa13.36□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PNKDQ8N490 385 aa13.36□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CACNG8Q8WXS5 425 aa13.36□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa13.36□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MC5RP33032 325 aa13.36□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MOB3BQ86TA1 216 aa13.36□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa13.36□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NECAP1Q8NC96 275 aa13.36□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LINC01560Q8TB33 94 aa13.36□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TNFRSF14Q92956 283 aa13.36□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DERL1Q9BUN8 251 aa13.36□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C19orf24Q9BVV8 132 aa13.36□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM133Q9H2Q1 129 aa13.36□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FUT9Q9Y231 359 aa13.36□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IFITM10A6NMD0 228 aa13.35□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GGCTO75223 188 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IL3RAP26951 378 aa13.35□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM78BQ5VT40 261 aa13.35□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR4P4Q8NGL7 312 aa13.35□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CGB1A6NKQ9 187 aa13.34□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 E7EUB6 86 aa13.34□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FOXH1O75593 365 aa13.34□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR10J1P30954 320 aa13.34□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HLA-DRB5Q30154 266 aa13.34□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MIR17HGQ75NE6 70 aa13.34□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa13.34□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C11orf52Q96A22 123 aa13.34□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ELOVL1Q9BW60 279 aa13.34□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CHODLQ9H9P2 273 aa13.34□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CEP295Q9C0D2 2601 aa13.34□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SCO2A0A1W2PP80 73 aa13.34□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM90A27PA6NNH2 459 aa13.34□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPP1R2P9O14990 202 aa13.34□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AREGP15514 252 aa13.34□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MUC15Q8N387 334 aa13.34□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IMMP2LQ96T52 175 aa13.34□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa13.33□□□□□ -0.27
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa13.33□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPP5D1E7EU14 171 aa13.33□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SIAH2O43255 324 aa13.33□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TYMSP04818 313 aa13.33□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR5G3P0C626 314 aa13.33□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WT1-ASQ06250 92 aa13.33□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MLANAQ16655 118 aa13.33□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VMA21Q3ZAQ7 101 aa13.33□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KCNIP4Q6PIL6 250 aa13.33□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR4X1Q8NH49 305 aa13.33□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM167BQ9NRX6 74 aa13.33□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LGALS7P47929 136 aa13.32□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPOXP50336 477 aa13.32□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KLRB1Q12918 225 aa13.32□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF841Q6ZN19 808 aa13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.2 ms