RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498841.5

PFKL-211, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PFKL, Length 3,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-211ENST00000498841 DUTP33316 252 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 COTL1Q14019 142 aa13.7□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 Q6ZVH6 145 aa13.7□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 ELOVL5Q9NYP7 299 aa13.7□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa13.7□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 C16orf97H3BN30 126 aa13.7□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 WNT2P09544 360 aa13.7□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 LINC00310P59036 64 aa13.7□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 GAGE1Q13065 139 aa13.7□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 OR10P1Q8NGE3 313 aa13.7□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 NPCDR1Q9BY65 106 aa13.7□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 DSCAML1Q8TD84 2053 aa13.7□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 FAM90A27PA6NNH2 459 aa13.7□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 YPEL1O60688 119 aa13.7□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 ZNF709Q8N972 641 aa13.7□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 PPP1R35Q8TAP8 253 aa13.7□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 YPEL2Q96QA6 119 aa13.7□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 TIMM9Q9Y5J7 89 aa13.7□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 S1PR3Q99500 378 aa13.69□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa13.69□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa13.69□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa13.69□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 TPPP2P59282 170 aa13.69□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 TMEM183BQ1AE95 376 aa13.69□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 CT45A1Q5HYN5 189 aa13.69□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 C11orf42Q8N5U0 333 aa13.69□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 CT45A3Q8NHU0 189 aa13.69□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 PRR7Q8TB68 274 aa13.69□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 TMEM147Q9BVK8 224 aa13.69□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 SFXN3Q9BWM7 321 aa13.69□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 TUBG2Q9NRH3 451 aa13.69□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 RNF114Q9Y508 228 aa13.69□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 LINC00614P0C842 121 aa13.68□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 TMEM108Q6UXF1 575 aa13.68□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 SSMEM1Q8WWF3 244 aa13.68□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 SFRP2Q96HF1 295 aa13.68□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 C20orf144Q9BQM9 153 aa13.68□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 SAMD10Q9BYL1 202 aa13.68□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 HSPB7Q9UBY9 170 aa13.68□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa13.68□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 RRHO14718 337 aa13.68□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 TIMP3P35625 211 aa13.68□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 TEX43Q6ZNM6 134 aa13.68□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 IFI27L2Q9H2X8 130 aa13.68□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa13.68□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 GRNP28799 593 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 LOXL3P58215 753 aa13.68□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 BAGE3Q86Y29 109 aa13.68□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 BAGE2Q86Y30 109 aa13.68□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa13.67□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 SLC17A3O00476 420 aa13.67□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 CRISP2P16562 243 aa13.67□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 NBL1P41271 181 aa13.67□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 ERVK-16P61578 105 aa13.67□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 MZT1Q08AG7 82 aa13.67□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 MMDQ15546 238 aa13.67□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 LINC01560Q8TB33 94 aa13.67□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 TMEM140Q9NV12 185 aa13.67□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 F6UZH7 168 aa13.67□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 IGHV3-48P01763 117 aa13.67□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 ADH4P08319 380 aa13.67□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 APELAP0DMC3 54 aa13.67□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 RAB7AP51149 207 aa13.67□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 KRTDAPP60985 99 aa13.67□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 PIEZO1Q92508 2521 aa13.67□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 TRAV34A0A0B4J273 112 aa13.66□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 TNFSF4P23510 183 aa13.66□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 ZNF90Q03938 601 aa13.66□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 C17orf58Q2M2W7 97 aa13.66□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 DYNLRB1Q9NP97 96 aa13.66□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 FOXL1Q12952 345 aa13.66□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 ADIPOQQ15848 244 aa13.66□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 TBR1Q16650 682 aa13.66□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 OR5AU1Q8NGC0 362 aa13.66□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 GAFA1Q96PS6 74 aa13.66□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 SAP30LQ9HAJ7 183 aa13.66□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 LY6HO94772 140 aa13.66□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 PLAUP00749 431 aa13.66□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 THBDP07204 575 aa13.66□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 CHRNB4P30926 498 aa13.66□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 LYPD2Q6UXB3 125 aa13.66□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 SPINK4O60575 86 aa13.65□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 IGKV1-16P04430 117 aa13.65□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 KRTCAP3Q53RY4 240 aa13.65□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 IGF2-ASQ6U949 168 aa13.65□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 MOB3BQ86TA1 216 aa13.65□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa13.65□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 ERASQ7Z444 233 aa13.65□□□□□ -0.22
PFKL-211ENST00000498841 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms