RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486829.1

ARHGEF3-211, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 428 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-211ENST00000486829 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP8.96□□□□□ -0.98
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ARHGEF3-211ENST00000486829 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
ARHGEF3-211ENST00000486829 CTRB2Q6GPI1 263 aa8.96□□□□□ -0.98
ARHGEF3-211ENST00000486829 NOXA1Q86UR1 476 aa8.96□□□□□ -0.98
ARHGEF3-211ENST00000486829 RNF152Q8N8N0 203 aa8.96□□□□□ -0.98
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR5AU1Q8NGC0 362 aa8.96□□□□□ -0.98
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.96□□□□□ -0.98
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ARHGEF3-211ENST00000486829 CITED4Q96RK1 184 aa8.96□□□□□ -0.98
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ARHGEF3-211ENST00000486829 SOX15O60248 233 aa8.94□□□□□ -0.98
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ARHGEF3-211ENST00000486829 SCGB1D2O95969 90 aa8.94□□□□□ -0.98
ARHGEF3-211ENST00000486829 MBPP02686 304 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
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ARHGEF3-211ENST00000486829 PF4V1P10720 104 aa8.94□□□□□ -0.98
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ARHGEF3-211ENST00000486829 TAS2R30P59541 319 aa8.94□□□□□ -0.98
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ARHGEF3-211ENST00000486829 SLC24A4Q8NFF2 622 aa8.94□□□□□ -0.98
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ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A0G2JLM5 398 aa8.93□□□□□ -0.98
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ARHGEF3-211ENST00000486829 S100A10P60903 97 aa8.93□□□□□ -0.98
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ARHGEF3-211ENST00000486829 FAM209BQ5JX69 171 aa8.93□□□□□ -0.98
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR11H7Q8NGC8 314 aa8.93□□□□□ -0.98
ARHGEF3-211ENST00000486829 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.93□□□□□ -0.98
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ARHGEF3-211ENST00000486829 P2RX4Q99571 388 aa8.93□□□□□ -0.98
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF747Q9BV97 191 aa8.93□□□□□ -0.98
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
ARHGEF3-211ENST00000486829 MAGT1Q9H0U3 335 aa8.93□□□□□ -0.98
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ARHGEF3-211ENST00000486829 NPY1RP25929 384 aa8.92□□□□□ -0.98
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ARHGEF3-211ENST00000486829 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa8.92□□□□□ -0.98
ARHGEF3-211ENST00000486829 UBE2E2Q96LR5 201 aa8.92□□□□□ -0.98
ARHGEF3-211ENST00000486829 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
ARHGEF3-211ENST00000486829 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
ARHGEF3-211ENST00000486829 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa8.91□□□□□ -0.98
ARHGEF3-211ENST00000486829 DEDDO75618 318 aa8.91□□□□□ -0.98
ARHGEF3-211ENST00000486829 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
ARHGEF3-211ENST00000486829 IAPPP10997 89 aa8.91□□□□□ -0.98
ARHGEF3-211ENST00000486829 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
ARHGEF3-211ENST00000486829 RAP2BP61225 183 aa8.91□□□□□ -0.98
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