RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 ACER3Q9NUN7 267 aa3.38□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 SEC16AO15027 2179 aa3.38□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 NEO1Q92859 1461 aa3.37□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM235A6NFC5 223 aa3.37□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 FABP5P3A8MUU1 101 aa3.37□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 C1QAP02745 245 aa3.37□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 CCL5P13501 91 aa3.37□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 CA5AP35218 305 aa3.37□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB134Q4QY38 66 aa3.37□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF767PQ75MW2 155 aa3.37□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 OR10K1Q8NGX5 313 aa3.37□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa3.37□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 GPR179Q6PRD1 2367 aa3.36□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 IFNA7P01567 189 aa3.36□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 GZMHP20718 246 aa3.36□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP10-3P60369 221 aa3.36□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 PYDC2Q56P42 97 aa3.36□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM70Q9BUB7 260 aa3.36□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 OR8D2Q9GZM6 311 aa3.36□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 BATF3Q9NR55 127 aa3.36□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa3.36□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 ADGRL1O94910 1474 aa3.35□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 KIF13BQ9NQT8 1826 aa3.35□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAV41A0A0B4J266 112 aa3.35□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 J3QRK9 145 aa3.35□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 RTL8CO15255 209 aa3.35□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 NBEAP1P0C6P0 100 aa3.35□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF728P0DKX0 622 aa3.35□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 CASP1P29466 404 aa3.35□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 ALDH3A1P30838 453 aa3.35□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 G6PCP35575 357 aa3.35□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 GLRXP35754 106 aa3.35□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 CCR2P41597 374 aa3.35□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 GABRA4P48169 554 aa3.35□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 PIGPP57054 158 aa3.35□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 PRR9Q5T870 116 aa3.35□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 LYSMD1Q96S90 227 aa3.35□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 CHST6Q9GZX3 395 aa3.35□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 C8orf4Q9NR00 106 aa3.35□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM215AQ9Y5M1 114 aa3.35□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0J9YW62 118 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 IRGMA1A4Y4 181 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAPPC2LH3BP13 241 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV3-7P01780 117 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 UCHL1P09936 223 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 SPANXN3Q5MJ09 141 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM78Q5T7P6 136 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 LYRM7Q5U5X0 104 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 DCUN1D2Q6PH85 259 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM24BQ8N5W8 94 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 OR5C1Q8NGR4 320 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 IMMP2LQ96T52 175 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 IMUPQ9GZP8 106 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 TIMM22Q9Y584 194 aa3.34□□□□□ -1.87
RABGGTB-209ENST00000473406 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 TRPM6Q9BX84 2022 aa3.34□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 MYH3P11055 1940 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 C11orf86A6NJI1 115 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 TSTD3H0UI37 97 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 H3BT86 120 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 ORC5O43913 435 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2J2O76002 312 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 IGFL1Q6UW32 110 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 LCA10Q71F78 164 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 MALSU1Q96EH3 234 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 SERPINI1Q99574 410 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 PBOV1Q9GZY1 135 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC39A9Q9NUM3 307 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 NAT8Q9UHE5 227 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 SHANK3Q9BYB0 1731 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 KIF1BO60333 1816 aa3.33□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 GNRH2O43555 120 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 BANF1O75531 89 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 BPGMP07738 259 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 S100A4P26447 101 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 SRIP30626 198 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 ARPC4P59998 168 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 IGFBP7Q16270 282 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 DYDC1Q8WWB3 177 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF122Q9H9V4 155 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 ARAP1Q96P48 1450 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 REREQ9P2R6 1566 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-209ENST00000473406 PLXNB1O43157 2135 aa3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.5 ms