RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262395.9

TRAF4-201, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF4, Length 2,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-201ENST00000262395 ZNF503Q96F45 646 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 ZNF586Q9NXT0 402 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 JPT1Q9UK76 154 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 C21orf140B9A014 251 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 IGKV3-15P01624 115 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 MAJINQ3KP22 176 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 Q8N976 141 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 PLEKHA3Q9HB20 300 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 CALYQ9NYX4 217 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 A0A1W2PS18 150 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 GGTLC3B5MD39 225 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 C9JCJ5 164 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 ESDP10768 282 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 ZNF83P51522 516 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 ETFRF1Q6IPR1 90 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 TMEM136Q6ZRR5 245 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 GCSAMQ8N6F7 178 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 C9orf106Q8NAJ2 232 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 OR4S2Q8NH73 311 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 FAM168AQ92567 244 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 C11orf52Q96A22 123 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 TRAV5A0A0B4J249 113 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 IGHV3-48P01763 117 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 PRR20EP86478 221 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 PRR20CP86479 221 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 PRR20DP86480 221 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 PRR20BP86481 221 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 PRR20AP86496 221 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 Q0VG73 95 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 OR9G1Q8NH87 305 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 SFXN3Q9BWM7 321 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 TUBG2Q9NRH3 451 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 OR51B2Q9Y5P1 312 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 LAMA5O15230 3695 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 TIGITQ495A1 244 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 UBALD2Q8IYN6 164 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 GNB1LQ9BYB4 327 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 ZFP30Q9Y2G7 519 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 ROS1P08922 2347 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 DSCAMO60469 2012 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 SPRY3O43610 288 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 MORN5Q5VZ52 161 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 DDB2Q92466 427 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 IL19Q9UHD0 177 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 LNP1A1A4G5 178 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 C20orf202A1L168 122 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 MGST3O14880 152 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 CX3CL1P78423 397 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 LCN12Q6JVE5 192 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 Q6ZVH6 145 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 STARD4Q96DR4 205 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 OR2V2Q96R30 315 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 CLCF1Q9UBD9 225 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAF4-201ENST00000262395 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa14.71□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.71□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 J3QR06 171 aa14.71□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 PTTG1IPP53801 180 aa14.71□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 OR10W1Q8NGF6 305 aa14.71□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 RND1Q92730 232 aa14.71□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 BMPR1BO00238 502 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 IGKV1-16P04430 117 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 AREGP15514 252 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 TRAT1Q6PIZ9 186 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 TMEM14BQ9NUH8 114 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 SRRM5B3KS81 715 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 TXN2Q99757 166 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 SLC45A2Q9UMX9 530 aa14.7□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 MMP23AO75900 390 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 C3orf79P0CE67 100 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 CCL11P51671 97 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 SLC35E1Q96K37 410 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 PLCE1Q9P212 2302 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 C17orf58Q2M2W7 97 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 Q6ZN92 141 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 STPG4Q8N801 248 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 NEUROG1Q92886 237 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 KCNS1Q96KK3 526 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 SGK494Q96LW2 274 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 RNF151Q2KHN1 245 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 C1orf174Q8IYL3 243 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 RNF2Q99496 336 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 CHODLQ9H9P2 273 aa14.69□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 IGLV2-8P01709 118 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 SLAQ13239 276 aa14.68□□□□□ -0.06
TRAF4-201ENST00000262395 PRR27Q6MZM9 219 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms