RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025804.5

Rab1b-201, Transcript of Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rab1b, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1b-201ENSMUST00000025804 CnmdQ9Z1F6 334 aa14.87□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm11756A2BEJ1 356 aa14.87□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Hoxb5P09079 269 aa14.87□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Cxcl1P12850 96 aa14.87□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 FblP35550 327 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Mdga2P60755 949 aa14.87□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr1058Q7TR74 316 aa14.87□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr487Q7TRU9 314 aa14.87□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Fam76bQ80XP8 339 aa14.87□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Tacstd2Q8BGV3 317 aa14.87□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Cbln4Q8BME9 198 aa14.87□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Scrt2Q8BTH6 311 aa14.87□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Dcun1d4Q8CCA0 292 aa14.87□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Tmem267Q8VDR5 215 aa14.87□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr1269Q8VEZ2 309 aa14.87□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr1265Q8VEZ3 309 aa14.87□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Flywch2Q9CQE9 139 aa14.87□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Lamp5Q9D387 280 aa14.87□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Lurap1Q9D6I9 239 aa14.87□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Angpt4Q9WVH6 509 aa14.87□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Cmya5Q70KF4 3739 aa14.86□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Nbeal1E9PYP2 2688 aa14.86□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm14548E9Q1Z6 680 aa14.86□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ca11O70354 328 aa14.86□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gabrr1P56475 480 aa14.86□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gimap1P70224 277 aa14.86□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 DbpQ60925 325 aa14.86□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr222Q7TS30 318 aa14.86□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Acaa1bQ8VCH0 424 aa14.86□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Lmo1Q924W9 156 aa14.86□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 GhsrQ99P50 364 aa14.86□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ing5Q9D8Y8 240 aa14.86□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr943Q9EQ92 314 aa14.86□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Bin3Q9JI08 253 aa14.86□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Zfyve26Q5DU37 2529 aa14.86□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm21117A0A087WPJ9 222 aa14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm20937A0A087WQA3 222 aa14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm21258A0A087WQC7 222 aa14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Iglv3A0A0B4J1K5 122 aa14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Trbv29A0A0G2LB96 114 aa14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm9925F6T2U3 160 aa14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rnd3P61588 244 aa14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 AesP63002 197 aa14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Prss44Q402U7 372 aa14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr1000Q7TR99 314 aa14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr452Q7TRV8 317 aa14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 GcaQ8VC88 220 aa14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr38Q8VGP4 317 aa14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Kcnmb2Q9CZM9 235 aa14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Lysmd2Q9D7V2 215 aa14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 9530002B09RikQ9EPV7 135 aa14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ighv5-9A0A075B5Q2 117 aa14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 1700003H04RikE9PXM2 192 aa14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm6594J3QM43 95 aa14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Hbb-bh0P04443 147 aa14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Klf2Q60843 354 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 PigmQ8C2R7 423 aa14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr1350Q8VF34 308 aa14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr720Q8VF37 316 aa14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Cacng8Q8VHW2 423 aa14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rnf151Q9CQ29 239 aa14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ndufb7Q9CR61 137 aa14.85□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Myo9bQ9QY06 2114 aa14.84□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Znf385cA2A5E6 429 aa14.84□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr1098A2AVB0 315 aa14.84□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm9972E9Q053 102 aa14.84□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm11009F7CWA7 138 aa14.84□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rdh16O54909 317 aa14.84□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 PkiaP63248 76 aa14.84□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 StumQ0VBF8 141 aa14.84□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 PcnpQ6P8I4 178 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Tox3Q80W03 575 aa14.84□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Q80X32 188 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ahsa1Q8BK64 338 aa14.84□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Mob1bQ8BPB0 216 aa14.84□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Scnm1Q8K136 229 aa14.84□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Znrf1Q91V17 227 aa14.84□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Magt1Q9CQY5 335 aa14.84□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 NmbQ9CR53 121 aa14.84□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr957Q9EQB7 311 aa14.84□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Chst1Q9EQC0 411 aa14.84□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Nat8Q9JIY7 227 aa14.84□□□□□ -0.03
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr1490A0A1L1SVH0 321 aa14.83□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 BC117090L7N257 96 aa14.83□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Ascl5M0QWB7 188 aa14.83□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Cd200O54901 278 aa14.83□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 H2-Q10P01898 325 aa14.83□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Rpl29P47915 160 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Slc25a4P48962 298 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gpr160Q3U3F9 336 aa14.83□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Gm21943Q5FWD5 227 aa14.83□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Taar8bQ5QD06 344 aa14.83□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Taar3Q5QD16 343 aa14.83□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Cstl1Q80Y72 140 aa14.83□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Mob3cQ8BJG4 216 aa14.83□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Nfam1Q8R4V1 264 aa14.83□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr1420Q8VF55 309 aa14.83□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Olfr1280Q8VGG8 305 aa14.83□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 IcaQ9DBD0 700 aa14.83□□□□□ -0.04
Rab1b-201ENSMUST00000025804 Irak1bp1Q9ESJ7 259 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49.1 ms