Protein–RNA interactions for Protein: P04443

Hbb-bh0, Hemoglobin subunit beta-H0, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh0P04443 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Hbb-bh0P04443 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hbb-bh0P04443 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Hbb-bh0P04443 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hbb-bh0P04443 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Hbb-bh0P04443 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hbb-bh0P04443 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hbb-bh0P04443 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hbb-bh0P04443 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Hbb-bh0P04443 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Hbb-bh0P04443 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hbb-bh0P04443 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hbb-bh0P04443 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hbb-bh0P04443 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Hbb-bh0P04443 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hbb-bh0P04443 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hbb-bh0P04443 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hbb-bh0P04443 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Hbb-bh0P04443 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hbb-bh0P04443 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hbb-bh0P04443 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hbb-bh0P04443 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hbb-bh0P04443 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hbb-bh0P04443 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hbb-bh0P04443 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hbb-bh0P04443 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Hbb-bh0P04443 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hbb-bh0P04443 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hbb-bh0P04443 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hbb-bh0P04443 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Hbb-bh0P04443 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hbb-bh0P04443 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hbb-bh0P04443 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hbb-bh0P04443 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hbb-bh0P04443 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hbb-bh0P04443 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hbb-bh0P04443 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hbb-bh0P04443 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hbb-bh0P04443 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hbb-bh0P04443 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hbb-bh0P04443 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hbb-bh0P04443 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hbb-bh0P04443 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hbb-bh0P04443 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hbb-bh0P04443 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hbb-bh0P04443 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hbb-bh0P04443 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hbb-bh0P04443 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hbb-bh0P04443 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hbb-bh0P04443 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hbb-bh0P04443 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hbb-bh0P04443 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hbb-bh0P04443 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hbb-bh0P04443 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hbb-bh0P04443 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hbb-bh0P04443 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Hbb-bh0P04443 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hbb-bh0P04443 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hbb-bh0P04443 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hbb-bh0P04443 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hbb-bh0P04443 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hbb-bh0P04443 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hbb-bh0P04443 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hbb-bh0P04443 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hbb-bh0P04443 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hbb-bh0P04443 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hbb-bh0P04443 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hbb-bh0P04443 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hbb-bh0P04443 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hbb-bh0P04443 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hbb-bh0P04443 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hbb-bh0P04443 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hbb-bh0P04443 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hbb-bh0P04443 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hbb-bh0P04443 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hbb-bh0P04443 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hbb-bh0P04443 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hbb-bh0P04443 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hbb-bh0P04443 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hbb-bh0P04443 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hbb-bh0P04443 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hbb-bh0P04443 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hbb-bh0P04443 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hbb-bh0P04443 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hbb-bh0P04443 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hbb-bh0P04443 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hbb-bh0P04443 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hbb-bh0P04443 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hbb-bh0P04443 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hbb-bh0P04443 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hbb-bh0P04443 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hbb-bh0P04443 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hbb-bh0P04443 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hbb-bh0P04443 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hbb-bh0P04443 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hbb-bh0P04443 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hbb-bh0P04443 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Hbb-bh0P04443 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hbb-bh0P04443 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hbb-bh0P04443 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms