Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NmbQ9CR53 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NmbQ9CR53 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NmbQ9CR53 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NmbQ9CR53 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NmbQ9CR53 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NmbQ9CR53 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NmbQ9CR53 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NmbQ9CR53 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NmbQ9CR53 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NmbQ9CR53 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NmbQ9CR53 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NmbQ9CR53 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NmbQ9CR53 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NmbQ9CR53 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NmbQ9CR53 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NmbQ9CR53 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NmbQ9CR53 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NmbQ9CR53 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NmbQ9CR53 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NmbQ9CR53 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NmbQ9CR53 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NmbQ9CR53 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NmbQ9CR53 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NmbQ9CR53 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NmbQ9CR53 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NmbQ9CR53 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NmbQ9CR53 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NmbQ9CR53 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NmbQ9CR53 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NmbQ9CR53 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NmbQ9CR53 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NmbQ9CR53 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NmbQ9CR53 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NmbQ9CR53 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NmbQ9CR53 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NmbQ9CR53 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NmbQ9CR53 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NmbQ9CR53 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NmbQ9CR53 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NmbQ9CR53 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NmbQ9CR53 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NmbQ9CR53 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NmbQ9CR53 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NmbQ9CR53 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NmbQ9CR53 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NmbQ9CR53 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NmbQ9CR53 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NmbQ9CR53 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NmbQ9CR53 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NmbQ9CR53 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NmbQ9CR53 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NmbQ9CR53 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NmbQ9CR53 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NmbQ9CR53 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NmbQ9CR53 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NmbQ9CR53 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NmbQ9CR53 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NmbQ9CR53 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NmbQ9CR53 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NmbQ9CR53 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NmbQ9CR53 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NmbQ9CR53 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NmbQ9CR53 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NmbQ9CR53 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NmbQ9CR53 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NmbQ9CR53 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NmbQ9CR53 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NmbQ9CR53 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NmbQ9CR53 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NmbQ9CR53 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NmbQ9CR53 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NmbQ9CR53 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NmbQ9CR53 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NmbQ9CR53 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NmbQ9CR53 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NmbQ9CR53 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NmbQ9CR53 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NmbQ9CR53 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NmbQ9CR53 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NmbQ9CR53 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NmbQ9CR53 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NmbQ9CR53 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NmbQ9CR53 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NmbQ9CR53 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NmbQ9CR53 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NmbQ9CR53 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NmbQ9CR53 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NmbQ9CR53 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NmbQ9CR53 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NmbQ9CR53 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NmbQ9CR53 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NmbQ9CR53 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NmbQ9CR53 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NmbQ9CR53 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NmbQ9CR53 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NmbQ9CR53 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NmbQ9CR53 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NmbQ9CR53 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NmbQ9CR53 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms