Protein–RNA interactions for Protein: P56475

Gabrr1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrr1P56475 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Gabrr1P56475 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gabrr1P56475 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gabrr1P56475 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gabrr1P56475 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gabrr1P56475 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Gabrr1P56475 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gabrr1P56475 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gabrr1P56475 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gabrr1P56475 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Gabrr1P56475 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Gabrr1P56475 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gabrr1P56475 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Gabrr1P56475 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gabrr1P56475 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gabrr1P56475 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gabrr1P56475 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gabrr1P56475 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Gabrr1P56475 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gabrr1P56475 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gabrr1P56475 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gabrr1P56475 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Gabrr1P56475 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gabrr1P56475 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gabrr1P56475 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gabrr1P56475 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gabrr1P56475 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gabrr1P56475 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gabrr1P56475 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gabrr1P56475 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gabrr1P56475 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gabrr1P56475 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gabrr1P56475 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gabrr1P56475 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gabrr1P56475 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Gabrr1P56475 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gabrr1P56475 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gabrr1P56475 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gabrr1P56475 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gabrr1P56475 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gabrr1P56475 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gabrr1P56475 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gabrr1P56475 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gabrr1P56475 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gabrr1P56475 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gabrr1P56475 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gabrr1P56475 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gabrr1P56475 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gabrr1P56475 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabrr1P56475 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabrr1P56475 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gabrr1P56475 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabrr1P56475 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gabrr1P56475 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gabrr1P56475 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabrr1P56475 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gabrr1P56475 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gabrr1P56475 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gabrr1P56475 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gabrr1P56475 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gabrr1P56475 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gabrr1P56475 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gabrr1P56475 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabrr1P56475 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gabrr1P56475 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gabrr1P56475 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gabrr1P56475 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gabrr1P56475 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gabrr1P56475 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gabrr1P56475 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gabrr1P56475 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gabrr1P56475 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gabrr1P56475 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gabrr1P56475 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gabrr1P56475 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gabrr1P56475 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabrr1P56475 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabrr1P56475 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabrr1P56475 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gabrr1P56475 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gabrr1P56475 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabrr1P56475 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gabrr1P56475 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gabrr1P56475 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabrr1P56475 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gabrr1P56475 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gabrr1P56475 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gabrr1P56475 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gabrr1P56475 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gabrr1P56475 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gabrr1P56475 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gabrr1P56475 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gabrr1P56475 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabrr1P56475 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gabrr1P56475 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gabrr1P56475 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gabrr1P56475 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gabrr1P56475 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gabrr1P56475 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gabrr1P56475 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms