Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Lmo1Q924W9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lmo1Q924W9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Lmo1Q924W9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Lmo1Q924W9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Lmo1Q924W9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Lmo1Q924W9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Lmo1Q924W9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lmo1Q924W9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Lmo1Q924W9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmo1Q924W9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Lmo1Q924W9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmo1Q924W9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmo1Q924W9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmo1Q924W9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmo1Q924W9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmo1Q924W9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmo1Q924W9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lmo1Q924W9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmo1Q924W9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmo1Q924W9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmo1Q924W9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmo1Q924W9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmo1Q924W9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lmo1Q924W9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmo1Q924W9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmo1Q924W9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmo1Q924W9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lmo1Q924W9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmo1Q924W9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmo1Q924W9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lmo1Q924W9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lmo1Q924W9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lmo1Q924W9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lmo1Q924W9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lmo1Q924W9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Lmo1Q924W9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Lmo1Q924W9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Lmo1Q924W9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Lmo1Q924W9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Lmo1Q924W9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lmo1Q924W9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lmo1Q924W9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lmo1Q924W9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmo1Q924W9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmo1Q924W9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lmo1Q924W9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lmo1Q924W9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Lmo1Q924W9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lmo1Q924W9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lmo1Q924W9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmo1Q924W9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmo1Q924W9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmo1Q924W9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmo1Q924W9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmo1Q924W9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmo1Q924W9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmo1Q924W9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmo1Q924W9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmo1Q924W9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmo1Q924W9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmo1Q924W9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmo1Q924W9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmo1Q924W9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmo1Q924W9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmo1Q924W9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmo1Q924W9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lmo1Q924W9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lmo1Q924W9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lmo1Q924W9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lmo1Q924W9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmo1Q924W9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Lmo1Q924W9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lmo1Q924W9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lmo1Q924W9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lmo1Q924W9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lmo1Q924W9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmo1Q924W9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmo1Q924W9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmo1Q924W9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lmo1Q924W9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lmo1Q924W9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lmo1Q924W9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lmo1Q924W9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lmo1Q924W9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmo1Q924W9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lmo1Q924W9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lmo1Q924W9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmo1Q924W9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lmo1Q924W9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmo1Q924W9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lmo1Q924W9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lmo1Q924W9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmo1Q924W9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmo1Q924W9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmo1Q924W9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmo1Q924W9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmo1Q924W9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmo1Q924W9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmo1Q924W9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
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