Protein–RNA interactions for Protein: O54901

Cd200, OX-2 membrane glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200O54901 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Cd200O54901 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cd200O54901 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cd200O54901 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cd200O54901 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cd200O54901 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cd200O54901 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cd200O54901 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cd200O54901 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cd200O54901 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cd200O54901 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cd200O54901 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cd200O54901 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cd200O54901 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cd200O54901 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cd200O54901 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cd200O54901 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cd200O54901 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cd200O54901 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cd200O54901 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cd200O54901 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Cd200O54901 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Cd200O54901 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cd200O54901 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cd200O54901 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cd200O54901 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cd200O54901 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cd200O54901 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cd200O54901 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cd200O54901 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cd200O54901 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cd200O54901 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cd200O54901 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cd200O54901 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cd200O54901 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Cd200O54901 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cd200O54901 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd200O54901 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cd200O54901 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cd200O54901 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd200O54901 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cd200O54901 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd200O54901 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cd200O54901 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cd200O54901 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cd200O54901 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cd200O54901 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cd200O54901 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cd200O54901 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cd200O54901 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cd200O54901 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cd200O54901 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cd200O54901 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd200O54901 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cd200O54901 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd200O54901 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd200O54901 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cd200O54901 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cd200O54901 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd200O54901 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd200O54901 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd200O54901 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd200O54901 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd200O54901 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd200O54901 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd200O54901 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd200O54901 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd200O54901 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cd200O54901 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd200O54901 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd200O54901 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd200O54901 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd200O54901 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd200O54901 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd200O54901 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd200O54901 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd200O54901 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cd200O54901 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd200O54901 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd200O54901 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd200O54901 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd200O54901 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd200O54901 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd200O54901 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cd200O54901 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd200O54901 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd200O54901 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd200O54901 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd200O54901 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd200O54901 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd200O54901 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cd200O54901 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd200O54901 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd200O54901 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd200O54901 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cd200O54901 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd200O54901 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd200O54901 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd200O54901 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cd200O54901 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms