RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 HNF4GQ14541 408 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 RAB1CQ92928 201 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 TIMD4Q96H15 378 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 APCP25054 2843 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 LY6HO94772 140 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 CA2P00918 260 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 PPIAL4GP0DN37 164 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 BCL2P10415 239 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 MC5RP33032 325 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 AWAT1Q58HT5 328 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 OR4A5Q8NH83 315 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 GNG13Q9P2W3 67 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 NOTCH2Q04721 2471 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 POLQO75417 2590 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1W2PPR1 153 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 FNDC10F2Z333 226 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 IGLV2-23P01705 113 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 PRRX1P54821 245 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 BSXQ3C1V8 233 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 HINT2Q9BX68 163 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 CHODLQ9H9P2 273 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 SMCO3A2RU48 225 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 ZFP92A6NM28 416 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 OPRK1P41145 380 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 RPL8P62917 257 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 C1orf159Q96HA4 380 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 P2RX4Q99571 388 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 MGST2Q99735 147 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 SLC25A22Q9H936 323 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.63□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1W2PPE2 198 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1W2PR64 198 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1W2PRV1 198 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 CYB5BO43169 146 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 IFNA1P01562 189 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 OPN1MWP04001 364 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 LIPFP07098 398 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 FBP1P09467 338 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 OPN1MW2P0DN77 364 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 OPN1MW3P0DN78 364 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 C2orf83Q53S99 150 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 PLXNB1O43157 2135 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 FBN2P35556 2912 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 C22orf46C9J442 243 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 M0R036 132 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 LGALS7P47929 136 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 DLX1P56177 255 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 RHEBQ15382 184 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 TEPPQ6URK8 271 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 RAB24Q969Q5 203 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.62□□□□□ -1.35
PDE4D-208ENST00000502484 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.62□□□□□ -1.35
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