RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636621.1

LINC00598-211, long intergenic non-protein coding RNA 598, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC00598, Length 3,241 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00598-211ENST00000636621 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 IL17BQ9UHF5 180 aa5.71□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa5.71□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 DSPP15924 2871 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 MT-ND6P03923 174 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 CECR9P0C854 216 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 COMPP49747 757 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 CLEC12BQ2HXU8 276 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 C3orf36Q3SXR2 165 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 IGFL2Q6UWQ7 119 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 Q6ZWC4 215 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 VASH2Q86V25 355 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 STPG3Q8N7X2 389 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 FAM222BQ8WU58 562 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 CORO2AQ92828 525 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 ZFHX4Q86UP3 3567 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 AQP7O14520 342 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 TCAPO15273 167 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 MMP23AO75900 390 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 CRYABP02511 175 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 REG1AP05451 166 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 LINC00869P0C866 280 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 IGHV3-43DP0DP04 118 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 CD59P13987 128 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 TPPP2P59282 170 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 ERVK-16P61578 105 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 GAGE1Q13065 139 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 TMEM30BQ3MIR4 351 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 OR10J3Q5JRS4 329 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 PLA2G2CQ5R387 149 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 RAB9BQ9NP90 201 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 TRAV3A0A0B4J244 114 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 LNP1A1A4G5 178 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 GATA4P43694 442 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 RPS16P62249 146 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 CX3CL1P78423 397 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 RTL8BQ17RB0 113 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 HLA-DRB5Q30154 266 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 TCF23Q7RTU1 214 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 GCSAMQ8N6F7 178 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 TPRX1Q8N7U7 411 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF439Q8NDP4 499 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 SLC24A4Q8NFF2 622 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 PPP1R35Q8TAP8 253 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 SLC35E1Q96K37 410 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 S1PR3Q99500 378 aa5.7□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 A0A1B0GUS0 222 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 DEFB108AA8MXU0 73 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 INS-IGF2F8WCM5 200 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 CGAP01215 116 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 NPY1RP25929 384 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 C17orf58Q2M2W7 97 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 RFESDQ8TAC1 157 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 LRRC29Q8WV35 223 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 SDSLQ96GA7 329 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 ADTRPQ96IZ2 230 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 DCTN5Q9BTE1 182 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 OSTCQ9NRP0 149 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 TMEM167BQ9NRX6 74 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 SLC45A2Q9UMX9 530 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 LOC400499M0QZD8 3231 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 M0R1X1 148 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 SCGB1D1O95968 90 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 TFF1P04155 84 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 CRISP2P16562 243 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 THBS3P49746 956 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 RAB31Q13636 194 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 RPEL1Q2QD12 228 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 RPL39P5Q59GN2 51 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 OR4A47Q6IF82 309 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 ABHD12Q8N2K0 398 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 LOXL4Q96JB6 756 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 UHRF2Q96PU4 802 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 SPOCK3Q9BQ16 436 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 DYSFO75923 2080 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 A8MXE2 369 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 ISLRO14498 428 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 SERF1AO75920 110 aa5.69□□□□□ -1.5
LINC00598-211ENST00000636621 IGHV3-13P01766 116 aa5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.7 ms