RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554186.1

LINC00520-201, long intergenic non-protein coding RNA 520, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00520, Length 831 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00520-201ENST00000554186 CD34P28906 385 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 RCVRNP35243 200 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 GNG2P59768 71 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 ARPC4P59998 168 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 LCN2P80188 198 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 DHODHQ02127 395 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 ARFRP1Q13795 201 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 CDK10Q15131 360 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 LY6G6FQ5SQ64 297 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 PQLC2Q6ZP29 291 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 NOXA1Q86UR1 476 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 STX12Q86Y82 276 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 CENPSQ8N2Z9 138 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 LHFPL5Q8TAF8 219 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 PIFOQ8TCI5 191 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 CAPSLQ8WWF8 208 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 ARL11Q969Q4 196 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 PPP1R14BQ96C90 147 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 ABHD14BQ96IU4 210 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 S100A13Q99584 98 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 FOXC2Q99958 501 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 MARVELD1Q9BSK0 173 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 REG4Q9BYZ8 158 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 IFI27L2Q9H2X8 130 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 C5orf66Q9H5L9 145 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 C12orf4Q9NQ89 552 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 CCL28Q9NRJ3 127 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 CALYQ9NYX4 217 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 CLN8Q9UBY8 286 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 MIOXQ9UGB7 285 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 MMP24Q9Y5R2 645 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 INSIG2Q9Y5U4 225 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 LINC00312Q9Y6C7 94 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 FBN3Q75N90 2809 aa3.4□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 TNCP24821 2201 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 LOC105371242A0A075B767 164 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 A0A0G2JRQ6 117 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 ISPDA4D126 451 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 LRRC30A6NM36 301 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 ODF3BA8MYP8 253 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 G3V3Q6 166 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 NDUFB3O43676 98 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 YPEL1O60688 119 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 SCGNO76038 276 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 NDUFB6O95139 128 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 RAB3DO95716 219 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 TCRBP04435 133 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 AKAIN1P0CW23 69 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 ZNF728P0DKX0 622 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 PPIAL4GP0DN37 164 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 OR5H8P0DN80 308 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 IGHV1-8P0DP01 117 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 IRF2P14316 349 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 SRD5A1P18405 259 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 USF1P22415 310 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 ZBTB25P24278 435 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 FCGR2CP31995 323 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 OR3A3P47888 321 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 EDDM3BP56851 147 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 ARF6P62330 175 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 RPL31P62899 125 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 PITPNAQ00169 270 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 CD300CQ08708 224 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 BAMBIQ13145 260 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 LTC4SQ16873 150 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 HEPN1Q6WQI6 88 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 IL17RELQ6ZVW7 336 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 OR10V1Q8NGI7 309 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 OR4P4Q8NGL7 312 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 OR4A4PQ8NGN8 299 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 MARCH1Q8TCQ1 289 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 YPEL2Q96QA6 119 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 LPAR2Q9HBW0 351 aa3.39□□□□□ -1.87
LINC00520-201ENST00000554186 RAB9BQ9NP90 201 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms