RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 B4GALT7Q9UBV7 327 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 MIC13Q5XKP0 118 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 DHRS13Q6UX07 377 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 ZNF596Q8TC21 504 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 DMXL1Q9Y485 3027 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 MEOX1P50221 254 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 RELBQ01201 579 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 DOLPP1Q86YN1 238 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 PMS2P5A8MQ11 134 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 TOMM40O96008 361 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 RAC2P15153 192 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 LINC00205P59089 165 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 CLEC7AQ9BXN2 247 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 CA2P00918 260 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 CD59P13987 128 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 RPL30P62888 115 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 NRN1LQ496H8 165 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 RNFT1Q5M7Z0 435 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 OR2D3Q8NGH3 330 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 ZPBPQ9BS86 351 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 GNB1LQ9BYB4 327 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-212ENST00000488380 RRHO14718 337 aa11.21□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 CLDN14O95500 239 aa11.21□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 CXorf1O96002 111 aa11.21□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 CELA3BP08861 270 aa11.21□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 SPOCK3Q9BQ16 436 aa11.21□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 C17orf98A8MV24 154 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 HSBP1O75506 76 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 GCM1Q9NP62 436 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 WISP2O76076 250 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 MGST1P10620 155 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 GNG4P50150 75 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 WDR73Q6P4I2 378 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 NIT1Q86X76 327 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 MRGPRDQ8TDS7 321 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 TSKUQ8WUA8 353 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 FAM122AQ96E09 287 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 SFXN3Q9BWM7 321 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 TP73-AS1Q9UF72 201 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 MT-CO3P00414 261 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 SP1P08047 785 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 GABRA2P47869 451 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 OR4A47Q6IF82 309 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 PQLC2Q6ZP29 291 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 MDP1Q86V88 176 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 WDR83OSQ9Y284 106 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 WASHC3Q9Y3C0 194 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 PSG1P11464 419 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 CATR1Q13166 79 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 OR10J3Q5JRS4 329 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 ACTL6BO94805 426 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 TNFSF15O95150 251 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 SP9P0CG40 484 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 ALKBH6Q3KRA9 238 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 CST9LQ9H4G1 147 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 SPRR3Q9UBC9 169 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 CLCF1Q9UBD9 225 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 HELTA6NFD8 242 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 PCNX2A6NKB5 2137 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 FOXH1O75593 365 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 MMP23AO75900 390 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 MT-ND6P03923 174 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 STAG3L2P0CL84 134 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 STAG3L3P0CL85 134 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 PLP2Q04941 152 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 PMCHL1Q16048 86 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 MPV17L2Q567V2 206 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 TMEM164Q5U3C3 297 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 WDR86Q86TI4 376 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 ZNF439Q8NDP4 499 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 NUDT10Q8NFP7 164 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 OR4P4Q8NGL7 312 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 TXNDC17Q9BRA2 123 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 KCNIP1Q9NZI2 227 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 ABI3Q9P2A4 366 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 V9GYV3 84 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 M0R2Z0 102 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 BMPR1BO00238 502 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 APCSP02743 223 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-212ENST00000488380 IGLL1P15814 213 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.9 ms