RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1B0GW64 132 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 FABP12A6NFH5 140 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 SEC14L6B5MCN3 397 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 PGAM2P15259 253 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 SLURP1P55000 103 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 C9orf66Q5T8R8 295 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 TERB2Q8NHR7 220 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 SOSTQ9BQB4 213 aa16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD34BA5PLL1 514 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 DPPA5A6NC42 116 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 KRASP01116 189 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 ERVK-16P61578 105 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 DEFA5Q01523 94 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-204ENST00000416021 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 MARCH11A6NNE9 402 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 OVOL1O14753 267 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 RHOGP84095 191 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF45Q02386 682 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF343Q6P1L6 599 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 MRAPQ8TCY5 172 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 AKIP1Q9NQ31 210 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 TNCP24821 2201 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 CGB1A6NKQ9 187 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 NPIPB5A8MRT5 1133 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 PI3P19957 117 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 G6PCP35575 357 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 OR2B8PP59922 312 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP5G2Q06055 141 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 MEF2DQ14814 521 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 CADM3Q8N126 398 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 COMMD5Q9GZQ3 224 aa16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM223BA6NKX1 122 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 CRYGCP07315 174 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 FGF2P09038 288 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 AREGP15514 252 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 PSMB6P28072 239 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 PIGPP57054 158 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 RND3P61587 244 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM223AQ8IWN6 122 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 ZFAND1Q8TCF1 268 aa16.24■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAH3Q8TD57 4116 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 DISC1C4P0D8 188 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 OR2J3O76001 311 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 AKAIN1P0CW23 69 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP16.23■□□□□ 0.192e-7■■■□□ 15.5
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP5CP53041 499 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 FAAP20Q6NZ36 180 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 C19orf35Q6ZS72 473 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 NECAP1Q8NC96 275 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 NSG2Q9Y328 171 aa16.23■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 SNAPC5O75971 98 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 REG1AP05451 166 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 CTRB1P17538 263 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 ZP3P21754 424 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 INSL3P51460 131 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 CTRB2Q6GPI1 263 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 MARCH1Q8TCQ1 289 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXL7Q9UJT9 491 aa16.22■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 K7EIL1 84 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 DHFRP00374 187 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 IGKV1-39P01597 117 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 TRBV12-3P01733 135 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 IGKV1D-39P04432 117 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 SERPINE2P07093 398 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAPPC2P0DI81 140 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAPPC2BP0DI82 140 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 DEFA4P12838 97 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 S100A5P33763 92 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF429Q86V71 674 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 OR4C16Q8NGL9 310 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 OR1L8Q8NGR8 309 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 OR13C8Q8NGS7 320 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 MRGPRFQ96AM1 343 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 SEC22AQ96IW7 307 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 FANCD2OSQ96PS1 177 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 COPZ2Q9P299 210 aa16.21■□□□□ 0.19
SH3BP4-204ENST00000416021 ECI1P42126 302 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 C15orf32Q32M92 178 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 DEFB121Q5J5C9 76 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-204ENST00000416021 ACSM6Q6P461 480 aa16.2■□□□□ 0.18
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