RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590843.1

SEH1L-208, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 5,206 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-208ENST00000590843 F8W036 122 aa9.5□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 GIPP09681 153 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 CRISP2P16562 243 aa9.5□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 PKIAP61925 76 aa9.5□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 ADIRFQ15847 76 aa9.5□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 SLC51BQ86UW2 128 aa9.5□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 SIGIRRQ6IA17 410 aa9.5□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 TMEM219Q86XT9 240 aa9.5□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa9.5□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.5□□□□□ -0.89
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SEH1L-208ENST00000590843 IL4P05112 153 aa9.5□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 KLHDC1Q8N7A1 406 aa9.5□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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SEH1L-208ENST00000590843 LINC00869P0C866 280 aa9.49□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 TDGF1P3P51864 188 aa9.49□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 MSGN1A6NI15 193 aa9.49□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 SMLR1H3BR10 107 aa9.49□□□□□ -0.89
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SEH1L-208ENST00000590843 GATCO43716 136 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
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SEH1L-208ENST00000590843 AKR1D1P51857 326 aa9.49□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 GAS1P54826 345 aa9.49□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 SUN5Q8TC36 379 aa9.49□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 KCNS1Q96KK3 526 aa9.49□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 ANK1P16157 1881 aa9.49□□□□□ -0.89
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SEH1L-208ENST00000590843 C1orf100Q5SVJ3 147 aa9.49□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 RPRMLQ8N4K4 120 aa9.49□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 CTDSP1Q9GZU7 261 aa9.49□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 MARCH11A6NNE9 402 aa9.49□□□□□ -0.89
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SEH1L-208ENST00000590843 ZNF90Q03938 601 aa9.49□□□□□ -0.89
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SEH1L-208ENST00000590843 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 HERPUD1Q15011 391 aa9.49□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 ZNF585BQ52M93 769 aa9.49□□□□□ -0.89
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SEH1L-208ENST00000590843 OR10G9Q8NGN4 311 aa9.48□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 OR10G7Q8NGN6 311 aa9.48□□□□□ -0.89
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SEH1L-208ENST00000590843 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
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SEH1L-208ENST00000590843 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa9.48□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 SLC31A2O15432 143 aa9.48□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 NDUFB6O95139 128 aa9.48□□□□□ -0.89
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SEH1L-208ENST00000590843 IGHV2-5P01817 119 aa9.48□□□□□ -0.89
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SEH1L-208ENST00000590843 C10orf111Q8N326 155 aa9.48□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 TMEM190Q8WZ59 177 aa9.48□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 YIPF5Q969M3 257 aa9.48□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 TCF19Q9Y242 345 aa9.48□□□□□ -0.89
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SEH1L-208ENST00000590843 CRYBA2P53672 197 aa9.48□□□□□ -0.89
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SEH1L-208ENST00000590843 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
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SEH1L-208ENST00000590843 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP9.47□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 TMEM41BQ5BJD5 291 aa9.47□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 LINC00114Q6XXX2 140 aa9.47□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 CUL9Q8IWT3 2517 aa9.47□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa9.47□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 IGHV4-39P01824 125 aa9.47□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 SULT1A1P50225 295 aa9.47□□□□□ -0.89
SEH1L-208ENST00000590843 UBE2V2Q15819 145 aa9.47□□□□□ -0.89
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