RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 RIPPLY3P57055 190 aa12.61□□□□□ -0.39
CTIF-205ENST00000587860 ZNF497Q6ZNH5 498 aa12.61□□□□□ -0.39
CTIF-205ENST00000587860 C5orf30Q96GV9 206 aa12.61□□□□□ -0.39
CTIF-205ENST00000587860 WSB1Q9Y6I7 421 aa12.61□□□□□ -0.39
CTIF-205ENST00000587860 CLDN34H7C241 214 aa12.6□□□□□ -0.39
CTIF-205ENST00000587860 BMP5P22003 454 aa12.6□□□□□ -0.39
CTIF-205ENST00000587860 RPL19P84098 196 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
CTIF-205ENST00000587860 UBE2V1Q13404 147 aa12.6□□□□□ -0.39
CTIF-205ENST00000587860 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa12.6□□□□□ -0.39
CTIF-205ENST00000587860 Q6ZT83 130 aa12.6□□□□□ -0.39
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CTIF-205ENST00000587860 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
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CTIF-205ENST00000587860 ERVK11-1P61568 191 aa12.59□□□□□ -0.39
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CTIF-205ENST00000587860 C17orf98A8MV24 154 aa12.58□□□□□ -0.39
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CTIF-205ENST00000587860 CTXN2P0C2S0 81 aa12.58□□□□□ -0.39
CTIF-205ENST00000587860 SRPXP78539 464 aa12.58□□□□□ -0.39
CTIF-205ENST00000587860 ZNRF1Q8ND25 227 aa12.58□□□□□ -0.39
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CTIF-205ENST00000587860 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 F6UZH7 168 aa12.58□□□□□ -0.4
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CTIF-205ENST00000587860 ZNF266Q14584 549 aa12.58□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 CORO2AQ92828 525 aa12.58□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 TNFRSF14Q92956 283 aa12.58□□□□□ -0.4
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CTIF-205ENST00000587860 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa12.58□□□□□ -0.4
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CTIF-205ENST00000587860 WDR82Q6UXN9 313 aa12.58□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 Q6ZS49 121 aa12.58□□□□□ -0.4
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CTIF-205ENST00000587860 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa12.57□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 SEM1Q6ZVN7 128 aa12.57□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 TMEM256Q8N2U0 113 aa12.57□□□□□ -0.4
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CTIF-205ENST00000587860 KCNIP1Q9NZI2 227 aa12.56□□□□□ -0.4
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CTIF-205ENST00000587860 TNFSF13O75888 250 aa12.55□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 GCH1P30793 250 aa12.55□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 BRWD1-AS2P59051 145 aa12.55□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 CD177Q8N6Q3 437 aa12.55□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 LINC00473A8K010 186 aa12.55□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 IQCF6A8MYZ5 107 aa12.55□□□□□ -0.4
CTIF-205ENST00000587860 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
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