RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567329.1

USP7-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 7, human

TSL 4

Gene USP7, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP7-217	ENST00000567329	RAB29	O14966	203 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	RAMP3	O60896	148 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	ZFAND5	O76080	213 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	PSG2	P11465	335 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	HNF1A	P20823	631 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	TNFSF4	P23510	183 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	TSPO	P30536	169 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	ZNF90	Q03938	601 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	FBLN7	Q53RD9	439 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	TCF24	Q7RTU0	167 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	LRP11	Q86VZ4	500 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	BAGE3	Q86Y29	109 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	BAGE2	Q86Y30	109 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	LYG1	Q8N1E2	194 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	OR5T1	Q8NG75	326 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	PSMF1	Q92530	271 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	DYRK2	Q92630	601 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	STARD4	Q96DR4	205 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	ALKBH3	Q96Q83	286 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	GPHA2	Q96T91	129 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	NRN1	Q9NPD7	142 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	SOHLH2	Q9NX45	425 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		5.82	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	LAMA1	P25391	3075 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329		A0A1W2PS18	150 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	DPRX	A6NFQ7	191 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	NDUFS8	O00217	210 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	S1PR2	O95136	353 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	NDUFB4	O95168	129 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	CXorf1	O96002	111 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	IGHV4-34	P06331	123 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	STAG3L2	P0CL84	134 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	STAG3L3	P0CL85	134 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	IAPP	P10997	89 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	GYPE	P15421	78 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	MAL	P21145	153 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	CDKN1A	P38936	164 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	CEACAM3	P40198	252 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	OPRK1	P41145	380 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	TFPI2	P48307	235 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	TMPRSS3	P57727	454 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	SELENOV	P59797	346 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	ARG2	P78540	354 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	GAGE13	Q4V321	117 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329		Q6ZN92	141 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	MUC15	Q8N387	334 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	FGFRL1	Q8N441	504 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	ZNF611	Q8N823	705 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	OCC1	Q8TAD7	63 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	APH1A	Q96BI3	265 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	KCNS1	Q96KK3	526 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	TXN2	Q99757	166 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	RBM24	Q9BX46	236 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	PRORY	Q9H606	182 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	HES4	Q9HCC6	221 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	OSTC	Q9NRP0	149 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		5.81	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		5.8	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		5.8	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	LRRC30	A6NM36	301 aa		5.8	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	GJE1	A6NN92	205 aa		5.8	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329		B4DGG1	531 aa		5.8	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		5.8	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		5.8	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329		H3BP45	60 aa		5.8	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	FCN1	O00602	326 aa		5.8	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	5.8	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48

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