RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 CT45A6P0DMU7 189 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 CT45A5P0DMU8 189 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 CT45A7P0DMV0 189 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 DLX6P56179 175 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 VWC2Q2TAL6 325 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 SPINK9Q5DT21 86 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 LINC00311Q8N616 119 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 RAB39BQ96DA2 213 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM147Q9BVK8 224 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 KIAA1456Q9P272 454 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 A0A087X0M5 115 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 TRAV3A0A0B4J244 114 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1B0GX30 115 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 C15orf61A6NNL5 157 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 C15orf62A8K5M9 175 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 GPR37O15354 613 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 SNAPINO95295 136 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 COL8A2P25067 703 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 OR4A47Q6IF82 309 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 KPTNQ9Y664 436 aa6.7□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 TNCP24821 2201 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 HBE1P02100 147 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 CCL20P78556 96 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 RTL8BQ17RB0 113 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 FAM71F2Q6NXP2 309 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 CLCC1Q96S66 551 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 RPRMQ9NS64 109 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 TCF19Q9Y242 345 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 AKAP6Q13023 2319 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 A0A1B0GV50 99 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 J3QR06 171 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV2-70P01814 119 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 LYNX1P0DP58 116 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 PPT1P50897 306 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 RAB2AP61019 212 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 OR13D1Q8NGV5 346 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 VSIRQ9H7M9 311 aa6.69□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 IGKV1-16P04430 117 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 NPBWR1P48145 328 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF137PP52743 207 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF841Q6ZN19 808 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM186Q96B77 213 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 CBLN4Q9NTU7 201 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 FAM74A7A6NL05 159 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 PRSS46E5RG02 174 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 C19orf84I3L1E1 186 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 IFNA10P01566 189 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 IGHV1-8P0DP01 117 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 FGF7P21781 194 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF726P1Q15940 193 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 OR9G1Q8NH87 305 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 RARRES2Q99969 163 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 RAB1BQ9H0U4 201 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 BET1LQ9NYM9 111 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.68□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 SPG11Q96JI7 2443 aa6.67□□□□□ -1.34
PDE4D-208ENST00000502484 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
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