RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa13.68□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 OR13D1Q8NGV5 346 aa13.68□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 AIFM2Q9BRQ8 373 aa13.68□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa13.68□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 SSX7Q7RTT5 188 aa13.68□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 RAB39BQ96DA2 213 aa13.68□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 SMDT1Q9H4I9 107 aa13.68□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
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TOM1-216ENST00000492723 ZNF787Q6DD87 383 aa13.67□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 ABHD12Q8N2K0 398 aa13.67□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 OR10X1Q8NGY0 326 aa13.67□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 CLDND2Q8NHS1 167 aa13.67□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 TMEM14BQ9NUH8 114 aa13.67□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 DLL1O00548 723 aa13.67□□□□□ -0.22
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TOM1-216ENST00000492723 REG1BP48304 166 aa13.67□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 CTRB2Q6GPI1 263 aa13.67□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 GNG13Q9P2W3 67 aa13.67□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 H7C2Y5 167 aa13.66□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 POU2AF1Q16633 256 aa13.66□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 TMEM155Q4W5P6 130 aa13.66□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 ACSM6Q6P461 480 aa13.66□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 ZNF709Q8N972 641 aa13.66□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 RXFP4Q8TDU9 374 aa13.66□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 MBD3L1Q8WWY6 194 aa13.66□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 TMEM204Q9BSN7 226 aa13.66□□□□□ -0.22
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TOM1-216ENST00000492723 MYOD1P15172 320 aa13.66□□□□□ -0.22
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TOM1-216ENST00000492723 DLX6P56179 175 aa13.66□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 ICAM4Q14773 271 aa13.66□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 SOHLH1Q5JUK2 328 aa13.66□□□□□ -0.22
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TOM1-216ENST00000492723 HINT2Q9BX68 163 aa13.66□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 J3QR06 171 aa13.65□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 M0R036 132 aa13.65□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 IGKV1D-33P01593 117 aa13.65□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 IGKV1-33P01594 117 aa13.65□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 CD1BP29016 333 aa13.65□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 ZNF506Q5JVG8 444 aa13.65□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 C20orf24Q9BUV8 137 aa13.65□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 OR51B2Q9Y5P1 312 aa13.65□□□□□ -0.22
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TOM1-216ENST00000492723 AKR1C3P42330 323 aa13.65□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 FFAR4Q5NUL3 377 aa13.65□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa13.65□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 ENY2Q9NPA8 101 aa13.65□□□□□ -0.22
TOM1-216ENST00000492723 ZFP92A6NM28 416 aa13.64□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 IFNA4P05014 189 aa13.64□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 AWAT1Q58HT5 328 aa13.64□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 FAM122CQ6P4D5 195 aa13.64□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 TMEM170AQ8WVE7 144 aa13.64□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 SLC39A9Q9NUM3 307 aa13.64□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 PRNDQ9UKY0 176 aa13.64□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 H0YJW9 148 aa13.64□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 SRP19P09132 144 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 PPOXP50336 477 aa13.64□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 RAB11AP62491 216 aa13.64□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa13.64□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 AVPI1Q5T686 147 aa13.64□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 RPS10P5Q9NQ39 176 aa13.64□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa13.63□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 C17orf112F2Z3M2 114 aa13.63□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 UPK2O00526 184 aa13.63□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 OPN1MWP04001 364 aa13.63□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 OPN1MW2P0DN77 364 aa13.63□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 OPN1MW3P0DN78 364 aa13.63□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 IGHV1-8P0DP01 117 aa13.63□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 MDKP21741 143 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa13.63□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 IGHV2-70P01814 119 aa13.63□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 MBP02144 154 aa13.63□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 KHDC3LQ587J8 217 aa13.63□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 LINC00311Q8N616 119 aa13.63□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 C8orf31Q8N9H6 132 aa13.63□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 OR10G4Q8NGN3 311 aa13.63□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 OR10G9Q8NGN4 311 aa13.63□□□□□ -0.23
TOM1-216ENST00000492723 OR10G7Q8NGN6 311 aa13.63□□□□□ -0.23
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