RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF383Q8NA42 475 aa23.77■■□□□ 1.4
ECHS1-201ENST00000368547 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
ECHS1-201ENST00000368547 C2orf50Q96LR7 162 aa23.77■■□□□ 1.4
ECHS1-201ENST00000368547 LINC00473A8K010 186 aa23.76■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 SERPINE2P07093 398 aa23.76■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 RPA2P15927 270 aa23.76■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 CD24P25063 80 aa23.76■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 BRS3P32247 399 aa23.76■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 TMEM268Q5VZI3 342 aa23.76■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa23.75■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 THBS3P49746 956 aa23.75■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 RPL30P62888 115 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 LYZL2Q7Z4W2 148 aa23.75■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 DYNLT3P51808 116 aa23.74■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 AANATQ16613 207 aa23.74■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 SLC35G3Q8N808 338 aa23.74■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 SEC22AQ96IW7 307 aa23.74■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 ADTRPQ96IZ2 230 aa23.74■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 H3BUX3 64 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 IER3P46695 156 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 OR5AN1Q8NGI8 311 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 PIFOQ8TCI5 191 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 OR10C1Q96KK4 312 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 H0YJW9 148 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 SNAPC5O75971 98 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 IGHV4-59P01825 116 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 VDAC1P21796 283 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 CD300LFQ8TDQ1 290 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 DDB2Q92466 427 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 COMMD9Q9P000 198 aa23.73■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 MPTX1A8MV57 137 aa23.72■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 CD1BP29016 333 aa23.72■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 IL15RAQ13261 267 aa23.72■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF585BQ52M93 769 aa23.72■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 Q5BKY6 102 aa23.72■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa23.71■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 VENTXO95231 258 aa23.71■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 MC5RP33032 325 aa23.71■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 OR11H4Q8NGC9 324 aa23.71■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa23.71■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 SSMEM1Q8WWF3 244 aa23.71■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 CUBNO60494 3623 aa23.71■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 H7C2Y5 167 aa23.7■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 IGKV1D-33P01593 117 aa23.7■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 IGKV1-33P01594 117 aa23.7■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 APOA2P02652 100 aa23.7■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 FBLN7Q53RD9 439 aa23.7■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 OR2B11Q5JQS5 317 aa23.7■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 SLC35D1Q9NTN3 355 aa23.7■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa23.7■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 WASHC3Q9Y3C0 194 aa23.7■■□□□ 1.39
ECHS1-201ENST00000368547 HES1Q14469 280 aa23.7■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 SPIN2AQ99865 258 aa23.7■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa23.7■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP23.69■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP23.69■■□□□ 1.388e-10■□□□□ 11.3
ECHS1-201ENST00000368547 FAM106CPP0CH98 169 aa23.69■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 KIR2DS2P43631 304 aa23.69■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 NMSQ5H8A3 153 aa23.69■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 THNSL2Q86YJ6 484 aa23.69■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 TNFRSF19Q9NS68 423 aa23.69■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa23.68■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 HMSDA8MTL9 139 aa23.68■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 FCGR3BO75015 233 aa23.68■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 SLC25A6P12236 298 aa23.68■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 PSMB6P28072 239 aa23.68■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 SPAG16Q8N0X2 631 aa23.68■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 BTBD17A6NE02 478 aa23.67■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 ATG12O94817 140 aa23.67■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 IGKV1-39P01597 117 aa23.67■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 IGKV1-16P04430 117 aa23.67■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 IGKV1D-39P04432 117 aa23.67■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 SLC25A4P12235 298 aa23.67■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 BRWD1-AS2P59051 145 aa23.67■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 HNF4GQ14541 408 aa23.67■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 LY6EQ16553 131 aa23.67■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 RTL8BQ17RB0 113 aa23.67■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 PDPNQ86YL7 162 aa23.67■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 OR5R1Q8NH85 324 aa23.67■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 DUX5Q96PT3 197 aa23.67■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 TCF19Q9Y242 345 aa23.67■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 LPAR6P43657 344 aa23.66■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 EBI3Q14213 229 aa23.66■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 OR2T10Q8NGZ9 312 aa23.66■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
ECHS1-201ENST00000368547 MPC2O95563 127 aa23.66■■□□□ 1.38
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