RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 CNKSR1Q969H4 720 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa27.12■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 CPA1P15085 419 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 STOX1Q6ZVD7 989 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 MPNDQ8N594 471 aa27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP27.11■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD1Q15327 319 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 TTLL5Q6EMB2 1281 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF384Q8TF68 577 aa27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 C6orf229H3BNL8 230 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 ARMT1Q9H993 441 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 DLEC1Q9Y238 1755 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 LAMA4Q16363 1823 aa27.09■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 E7EWF7 191 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 MECOMQ03112 1051 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 ADGRA1Q86SQ6 560 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 LCORLQ8N3X6 602 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 COA1Q9GZY4 146 aa27.08■■□□□ 1.93
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A0G2JLW4 131 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 GSG1L2A8MUP6 293 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM205AQ6ZU69 1335 aa27.07■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 SLX4Q8IY92 1834 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF13BQ9NQT8 1826 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF213O14771 459 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 IFNL3Q8IZI9 196 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 C7orf43Q8WVR3 580 aa27.06■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 PRDX5P30044 214 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 CHRNA5P30532 468 aa27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXL16Q8N461 479 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 MIGA1Q8NAN2 632 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 EYA3Q99504 573 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 NACAP1Q9BZK3 213 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa27.04■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 APPP05067 770 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 LDHBP07195 334 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 SNED1Q8TER0 1413 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 AGXT2Q9BYV1 514 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 FOXD4L1Q9NU39 408 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 WDR19Q8NEZ3 1342 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 GSTO1P78417 241 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 GRIPAP1Q4V328 841 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 GIMAP6Q6P9H5 292 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 OLFM4Q6UX06 510 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 NBPF3Q9H094 633 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 TIAM2Q8IVF5 1701 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-207ENST00000589146 PRKAB2O43741 272 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 NAPBQ9H115 298 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 HAND2P61296 217 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 TPCN1Q9ULQ1 816 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 LDHCP07864 332 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 RAB3GAP1Q15042 981 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 Q6ZUG5 572 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 NCOA7Q8NI08 942 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 MTFR1LQ9H019 292 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 JAG2Q9Y219 1238 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 RIMBP2O15034 1052 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 LARGE1O95461 756 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP4CP60510 307 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 NUCB2P80303 420 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 ME3Q16798 604 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 TBC1D10CQ8IV04 446 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP26.98■■□□□ 1.919e-10■■■□□ 16.6
CAPNS1-207ENST00000589146 TCEANC2Q96MN5 208 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 CHD4Q14839 1912 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 CERS3Q8IU89 383 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 ANAPC4Q9UJX5 808 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNA3P22001 575 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 TDO2P48775 406 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 GRIK5Q16478 980 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-207ENST00000589146 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
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