RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 UNC13BO14795 1591 aa13.24□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADGRL2O95490 1459 aa13.24□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 JCADQ9P266 1359 aa13.24□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 KCNA6P17658 529 aa13.24□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 SOX18P35713 384 aa13.24□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM129BQ96TA1 746 aa13.24□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGFLR1Q9H665 355 aa13.24□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 EID1Q9Y6B2 187 aa13.24□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 PSAPP07602 524 aa13.23□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 ALAS2P22557 587 aa13.23□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 NRLP54845 237 aa13.23□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPLD1P80108 840 aa13.23□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 PDE3BQ13370 1112 aa13.23□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCSK7Q16549 785 aa13.23□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR13H1Q8NG92 308 aa13.23□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 NHSL1Q5SYE7 1610 aa13.23□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 MSH6P52701 1360 aa13.22□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZBTB42B2RXF5 422 aa13.22□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLAURQ03405 335 aa13.22□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa13.22□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 BTBD6Q96KE9 485 aa13.22□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC6A14Q9UN76 642 aa13.22□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa13.21□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZBTB7CA1YPR0 619 aa13.21□□□□□ -0.29
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa13.21□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa13.21□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 TNFRSF21O75509 655 aa13.2□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGHA2P01877 340 aa13.2□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 IDI1Q13907 227 aa13.2□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 NEDD1Q8NHV4 660 aa13.2□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 CNTN3Q9P232 1028 aa13.2□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 E9PCH4 1651 aa13.2□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 KANK1Q14678 1352 aa13.2□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAPK1P28482 360 aa13.19□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHSY3Q70JA7 882 aa13.19□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa13.19□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 MARSP56192 900 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMC1Q8TDI8 760 aa13.18□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 SNX29Q8TEQ0 813 aa13.18□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 DMRTB1Q96MA1 342 aa13.18□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC26A8Q96RN1 970 aa13.18□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 STARD13Q9Y3M8 1113 aa13.18□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 IQGAP3Q86VI3 1631 aa13.17□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 AMPD1P23109 780 aa13.17□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 KANK3Q6NY19 840 aa13.17□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMC7Q7Z402 723 aa13.17□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 C1orf127Q8N9H9 656 aa13.17□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 NAGPAQ9UK23 515 aa13.17□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 EP400Q96L91 3159 aa13.17□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa13.16□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 RIMS2Q9UQ26 1411 aa13.16□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPR182O15218 404 aa13.16□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHRDQ9H2X0 955 aa13.16□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADAMTS8Q9UP79 889 aa13.16□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa13.16□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 LAMC1P11047 1609 aa13.16□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 DCCP43146 1447 aa13.15□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRPM2O94759 1503 aa13.15□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa13.15□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 PHF20L1A8MW92 1017 aa13.15□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 SIK1P57059 783 aa13.15□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM35AQ86V20 835 aa13.15□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 STK17AQ9UEE5 414 aa13.15□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa13.15□□□□□ -0.3
USP3-AS1-204ENST00000559861 NALCNQ8IZF0 1738 aa13.14□□□□□ -0.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM181BA6NEQ2 426 aa13.14□□□□□ -0.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 PHACTR2O75167 634 aa13.14□□□□□ -0.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 HYAL2Q12891 473 aa13.14□□□□□ -0.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 PMEPA1Q969W9 287 aa13.14□□□□□ -0.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 ASB16Q96NS5 453 aa13.14□□□□□ -0.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa13.14□□□□□ -0.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa13.14□□□□□ -0.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 PIK3R4Q99570 1358 aa13.13□□□□□ -0.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIF4AO95239 1232 aa13.13□□□□□ -0.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 CPB1P15086 417 aa13.13□□□□□ -0.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 CES1P23141 567 aa13.13□□□□□ -0.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 C20orf204Q6ZNR8 217 aa13.13□□□□□ -0.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 HFE2Q6ZVN8 426 aa13.13□□□□□ -0.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 J3QW42 95 aa13.12□□□□□ -0.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 ALBP02768 609 aa13.12□□□□□ -0.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 NEFLP07196 543 aa13.12□□□□□ -0.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 DGKGP49619 791 aa13.12□□□□□ -0.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 NIF3L1Q9GZT8 377 aa13.12□□□□□ -0.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa13.12□□□□□ -0.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC52A1Q9NWF4 448 aa13.12□□□□□ -0.31
USP3-AS1-204ENST00000559861 PERM1Q5SV97 790 aa13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.9 ms