RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556312.5

ACTR10-211, Transcript of actin related protein 10 homolog, humanhuman

TSL 2

Gene ACTR10, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR10-211ENST00000556312 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.24■■□□□ 1.15
ACTR10-211ENST00000556312 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ACTR10-211ENST00000556312 OPTNQ96CV9 577 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTR10-211ENST00000556312 PTPN18Q99952 460 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTR10-211ENST00000556312 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.23■■□□□ 1.15
ACTR10-211ENST00000556312 CACNB3P54284 484 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTR10-211ENST00000556312 METTL24Q5JXM2 366 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTR10-211ENST00000556312 TEPSINQ96N21 525 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTR10-211ENST00000556312 UNCXA6NJT0 531 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTR10-211ENST00000556312 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
ACTR10-211ENST00000556312 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTR10-211ENST00000556312 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTR10-211ENST00000556312 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTR10-211ENST00000556312 OTOFQ9HC10 1997 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTR10-211ENST00000556312 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 UTYO14607 1347 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 CAP1Q01518 475 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 VGLL4Q14135 290 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 ERO1AQ96HE7 468 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 POTEFA5A3E0 1075 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 BCAMP50895 628 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 BRCA2P51587 3418 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 TNNI2P48788 182 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 CCL15Q16663 113 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 OTUD5Q96G74 571 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 EFCC1Q9HA90 598 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 ZNF521Q96K83 1311 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 MAP3K9P80192 1104 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 SP3Q02447 781 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 TEKT1Q969V4 418 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 CSADQ9Y600 493 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 PDE8BO95263 885 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 LAMB1P07942 1786 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTR10-211ENST00000556312 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.14■■□□□ 1.13
ACTR10-211ENST00000556312 GTF2A2P52657 109 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTR10-211ENST00000556312 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTR10-211ENST00000556312 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.13■■□□□ 1.13
ACTR10-211ENST00000556312 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ACTR10-211ENST00000556312 PTPRCP08575 1304 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTR10-211ENST00000556312 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ACTR10-211ENST00000556312 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ACTR10-211ENST00000556312 WRNIP1Q96S55 665 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTR10-211ENST00000556312 USP44Q9H0E7 712 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTR10-211ENST00000556312 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.12■■□□□ 1.13
ACTR10-211ENST00000556312 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ACTR10-211ENST00000556312 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ACTR10-211ENST00000556312 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ACTR10-211ENST00000556312 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTR10-211ENST00000556312 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.11■■□□□ 1.13
ACTR10-211ENST00000556312 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTR10-211ENST00000556312 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ACTR10-211ENST00000556312 ARMC5Q96C12 935 aa22.1■■□□□ 1.13
ACTR10-211ENST00000556312 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ACTR10-211ENST00000556312 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ACTR10-211ENST00000556312 FGFR2P21802 821 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTR10-211ENST00000556312 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.09■■□□□ 1.13
ACTR10-211ENST00000556312 MAST3O60307 1309 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTR10-211ENST00000556312 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ACTR10-211ENST00000556312 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.08■■□□□ 1.13
ACTR10-211ENST00000556312 BTBD19C9JJ37 291 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTR10-211ENST00000556312 E9PSI1 815 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTR10-211ENST00000556312 EYA2O00167 538 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTR10-211ENST00000556312 SLC5A1P13866 664 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTR10-211ENST00000556312 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ACTR10-211ENST00000556312 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ACTR10-211ENST00000556312 FAM83AQ86UY5 434 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTR10-211ENST00000556312 ERO1BQ86YB8 467 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTR10-211ENST00000556312 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTR10-211ENST00000556312 SIL1Q9H173 461 aa22.07■■□□□ 1.12
ACTR10-211ENST00000556312 IRF6O14896 467 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTR10-211ENST00000556312 CETPP11597 493 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTR10-211ENST00000556312 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTR10-211ENST00000556312 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTR10-211ENST00000556312 KIF16BQ96L93 1317 aa22.06■■□□□ 1.12
ACTR10-211ENST00000556312 INPP5BP32019 993 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTR10-211ENST00000556312 TCP10Q12799 353 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTR10-211ENST00000556312 SNAPC2Q13487 334 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTR10-211ENST00000556312 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTR10-211ENST00000556312 LPIN2Q92539 896 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTR10-211ENST00000556312 ZNF333Q96JL9 665 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTR10-211ENST00000556312 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTR10-211ENST00000556312 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTR10-211ENST00000556312 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.05■■□□□ 1.12
ACTR10-211ENST00000556312 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.04■■□□□ 1.12
ACTR10-211ENST00000556312 DCAF15Q66K64 600 aa22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms