RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554945.1

SRP54-AS1-201, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 600 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 WNK4Q96J92 1243 aa11.89□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CLMNQ96JQ2 1002 aa11.89□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 VEZTQ9HBM0 779 aa11.89□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PCDH10Q9P2E7 1040 aa11.89□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SSC5DA1L4H1 1573 aa11.88□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ANP32CO43423 234 aa11.88□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 USP2O75604 605 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TNFAIP1Q13829 316 aa11.88□□□□□ -0.51
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa11.88□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa11.88□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa11.88□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SERPINA10Q9UK55 444 aa11.88□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 JAG2Q9Y219 1238 aa11.88□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ARAP2Q8WZ64 1704 aa11.87□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP11.87□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MFSD14BQ5SR56 506 aa11.87□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SLC4A10Q6U841 1118 aa11.87□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GYG1P46976 350 aa11.86□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 OTOP1Q7RTM1 612 aa11.86□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ERO1AQ96HE7 468 aa11.86□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRIM17Q9Y577 477 aa11.86□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 AOX1Q06278 1338 aa11.86□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MROH5Q6ZUA9 1318 aa11.86□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 OTOFQ9HC10 1997 aa11.85□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TNNI2P48788 182 aa11.85□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SUCLG2Q96I99 432 aa11.85□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa11.85□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CENPFP49454 3210 aa11.85□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 UTYO14607 1347 aa11.85□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GJA5P36382 358 aa11.84□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CRHR2Q13324 411 aa11.84□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FBXO33Q7Z6M2 555 aa11.84□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 VPS37DQ86XT2 251 aa11.84□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 OPTNQ96CV9 577 aa11.84□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KAZALD1Q96I82 304 aa11.84□□□□□ -0.51
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HTTP42858 3142 aa11.83□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TCP10L2B9ZVM9 353 aa11.83□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CRKP46108 304 aa11.83□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SP3Q02447 781 aa11.83□□□□□ -0.52
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SRP54-AS1-201ENST00000554945 CAVIN4Q5BKX8 364 aa11.83□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa11.83□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TEPSINQ96N21 525 aa11.83□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PTPN18Q99952 460 aa11.83□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ELP3Q9H9T3 547 aa11.83□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 EFCC1Q9HA90 598 aa11.83□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PTPN22Q9Y2R2 807 aa11.83□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MAP3K9P80192 1104 aa11.82□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ARHGEF6Q15052 776 aa11.82□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FAM9BQ8IZU0 186 aa11.82□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CD99L2Q8TCZ2 262 aa11.82□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MS4A4AQ96JQ5 239 aa11.82□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MRIQ9BWK5 157 aa11.82□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMEM39BQ9GZU3 492 aa11.82□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CSADQ9Y600 493 aa11.82□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PDE8BO95263 885 aa11.81□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GTF2A2P52657 109 aa11.81□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 VGLL4Q14135 290 aa11.81□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LRRC24Q50LG9 513 aa11.81□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 METTL24Q5JXM2 366 aa11.81□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP11.81□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TEKT1Q969V4 418 aa11.81□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GCC1Q96CN9 775 aa11.81□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PTPRCP08575 1304 aa11.81□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa11.8□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 POTEFA5A3E0 1075 aa11.8□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GRIK5Q16478 980 aa11.8□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CCL15Q16663 113 aa11.8□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 VGLL2Q8N8G2 317 aa11.8□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ARMC5Q96C12 935 aa11.8□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HOOK2Q96ED9 719 aa11.8□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZDHHC15Q96MV8 337 aa11.8□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa11.8□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMOD2Q9NZR1 351 aa11.8□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 METRNQ9UJH8 293 aa11.8□□□□□ -0.52
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
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