RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 OTOFQ9HC10 1997 aa30.15■■■□□ 2.42
ACER3-211ENST00000531461 FKTNO75072 461 aa30.14■■■□□ 2.42
ACER3-211ENST00000531461 CRKP46108 304 aa30.14■■■□□ 2.42
ACER3-211ENST00000531461 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
ACER3-211ENST00000531461 MRIQ9BWK5 157 aa30.13■■■□□ 2.41
ACER3-211ENST00000531461 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa30.13■■■□□ 2.41
ACER3-211ENST00000531461 TEPSINQ96N21 525 aa30.12■■■□□ 2.41
ACER3-211ENST00000531461 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa30.12■■■□□ 2.41
ACER3-211ENST00000531461 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
ACER3-211ENST00000531461 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
ACER3-211ENST00000531461 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa30.11■■■□□ 2.41
ACER3-211ENST00000531461 FGFR2P21802 821 aa30.1■■■□□ 2.41
ACER3-211ENST00000531461 TNNI2P48788 182 aa30.1■■■□□ 2.41
ACER3-211ENST00000531461 SOX10P56693 466 aa30.1■■■□□ 2.41
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ACER3-211ENST00000531461 KLHDC4Q8TBB5 520 aa30.1■■■□□ 2.41
ACER3-211ENST00000531461 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
ACER3-211ENST00000531461 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP30.09■■■□□ 2.41
ACER3-211ENST00000531461 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
ACER3-211ENST00000531461 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
ACER3-211ENST00000531461 GRIK5Q16478 980 aa30.09■■■□□ 2.41
ACER3-211ENST00000531461 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
ACER3-211ENST00000531461 MYH13Q9UKX3 1938 aa30.08■■■□□ 2.41
ACER3-211ENST00000531461 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
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ACER3-211ENST00000531461 GJA5P36382 358 aa30.08■■■□□ 2.41
ACER3-211ENST00000531461 TEKT1Q969V4 418 aa30.08■■■□□ 2.41
ACER3-211ENST00000531461 BCAMP50895 628 aa30.07■■■□□ 2.4
ACER3-211ENST00000531461 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP30.07■■■□□ 2.4
ACER3-211ENST00000531461 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa30.07■■■□□ 2.4
ACER3-211ENST00000531461 MAST3O60307 1309 aa30.06■■■□□ 2.4
ACER3-211ENST00000531461 EYA2O00167 538 aa30.06■■■□□ 2.4
ACER3-211ENST00000531461 CDCA7LQ96GN5 454 aa30.06■■■□□ 2.4
ACER3-211ENST00000531461 ZDHHC15Q96MV8 337 aa30.06■■■□□ 2.4
ACER3-211ENST00000531461 SMC4Q9NTJ3 1288 aa30.06■■■□□ 2.4
ACER3-211ENST00000531461 FBXO3Q9UK99 471 aa30.06■■■□□ 2.4
ACER3-211ENST00000531461 TCP10L2B9ZVM9 353 aa30.05■■■□□ 2.4
ACER3-211ENST00000531461 TMEM39BQ9GZU3 492 aa30.05■■■□□ 2.4
ACER3-211ENST00000531461 FKBP1CQ5VVH2 108 aa30.04■■■□□ 2.4
ACER3-211ENST00000531461 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
ACER3-211ENST00000531461 CDAN1Q8IWY9 1227 aa30.04■■■□□ 2.4
ACER3-211ENST00000531461 LPIN2Q92539 896 aa30.04■■■□□ 2.4
ACER3-211ENST00000531461 HHIPL2Q6UWX4 724 aa30.03■■■□□ 2.4
ACER3-211ENST00000531461 FAM83AQ86UY5 434 aa30.03■■■□□ 2.4
ACER3-211ENST00000531461 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP30.03■■■□□ 2.4
ACER3-211ENST00000531461 OPTNQ96CV9 577 aa30.03■■■□□ 2.4
ACER3-211ENST00000531461 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
ACER3-211ENST00000531461 HTTP42858 3142 aa30.03■■■□□ 2.4
ACER3-211ENST00000531461 SLC5A1P13866 664 aa30.02■■■□□ 2.4
ACER3-211ENST00000531461 MAP3K9P80192 1104 aa30.02■■■□□ 2.4
ACER3-211ENST00000531461 MS4A4AQ96JQ5 239 aa30.02■■■□□ 2.4
ACER3-211ENST00000531461 PTPN18Q99952 460 aa30.02■■■□□ 2.4
ACER3-211ENST00000531461 ELP3Q9H9T3 547 aa30.02■■■□□ 2.4
ACER3-211ENST00000531461 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
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ACER3-211ENST00000531461 CIAO1O76071 339 aa30■■■□□ 2.39
ACER3-211ENST00000531461 WDR66Q8TBY9 1149 aa30■■■□□ 2.39
ACER3-211ENST00000531461 TMOD2Q9NZR1 351 aa30■■■□□ 2.39
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ACER3-211ENST00000531461 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
ACER3-211ENST00000531461 OTOP1Q7RTM1 612 aa29.98■■■□□ 2.39
ACER3-211ENST00000531461 HOOK2Q96ED9 719 aa29.98■■■□□ 2.39
ACER3-211ENST00000531461 ERO1AQ96HE7 468 aa29.98■■■□□ 2.39
ACER3-211ENST00000531461 CSADQ9Y600 493 aa29.98■■■□□ 2.39
ACER3-211ENST00000531461 ZBTB22O15209 634 aa29.97■■■□□ 2.39
ACER3-211ENST00000531461 SLC34A2O95436 690 aa29.97■■■□□ 2.39
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ACER3-211ENST00000531461 GTF2A2P52657 109 aa29.96■■■□□ 2.39
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ACER3-211ENST00000531461 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
ACER3-211ENST00000531461 CENPFP49454 3210 aa29.94■■■□□ 2.38
ACER3-211ENST00000531461 SPDYE5A6NIY4 337 aa29.94■■■□□ 2.38
ACER3-211ENST00000531461 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa29.94■■■□□ 2.38
ACER3-211ENST00000531461 BRI3BPQ8WY22 251 aa29.94■■■□□ 2.38
ACER3-211ENST00000531461 CEP126Q9P2H0 1117 aa29.94■■■□□ 2.38
ACER3-211ENST00000531461 CCER2I3L3R5 266 aa29.93■■■□□ 2.38
ACER3-211ENST00000531461 SP3Q02447 781 aa29.93■■■□□ 2.38
ACER3-211ENST00000531461 ATP2B3Q16720 1220 aa29.93■■■□□ 2.38
ACER3-211ENST00000531461 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa29.92■■■□□ 2.38
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ACER3-211ENST00000531461 CCL15Q16663 113 aa29.92■■■□□ 2.38
ACER3-211ENST00000531461 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
ACER3-211ENST00000531461 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
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ACER3-211ENST00000531461 SALL1Q9NSC2 1324 aa29.92■■■□□ 2.38
ACER3-211ENST00000531461 SEMA3EO15041 775 aa29.91■■■□□ 2.38
ACER3-211ENST00000531461 DCAF15Q66K64 600 aa29.91■■■□□ 2.38
ACER3-211ENST00000531461 ERO1BQ86YB8 467 aa29.91■■■□□ 2.38
ACER3-211ENST00000531461 ARHGAP45Q92619 1136 aa29.91■■■□□ 2.38
ACER3-211ENST00000531461 OTUD5Q96G74 571 aa29.91■■■□□ 2.38
ACER3-211ENST00000531461 SIL1Q9H173 461 aa29.91■■■□□ 2.38
ACER3-211ENST00000531461 COPRSQ9NQ92 184 aa29.91■■■□□ 2.38
ACER3-211ENST00000531461 PTPN22Q9Y2R2 807 aa29.91■■■□□ 2.38
ACER3-211ENST00000531461 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
ACER3-211ENST00000531461 CD99L2Q8TCZ2 262 aa29.9■■■□□ 2.38
ACER3-211ENST00000531461 WRNIP1Q96S55 665 aa29.9■■■□□ 2.38
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