RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496465.1

TM2D1-211, Transcript of TM2 domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TM2D1, Length 577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1-211ENST00000496465 MRIQ9BWK5 157 aa22.72■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 UNCXA6NJT0 531 aa22.71■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 GNAI3P08754 354 aa22.71■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 TM4SF4P48230 202 aa22.71■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 TNFAIP1Q13829 316 aa22.71■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 RASA3Q14644 834 aa22.71■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 SIL1Q9H173 461 aa22.71■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 COPRSQ9NQ92 184 aa22.71■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.71■■□□□ 1.23
TM2D1-211ENST00000496465 TRIM27P14373 513 aa22.7■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.7■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 FZD1Q9UP38 647 aa22.7■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 BCAR3O75815 825 aa22.69■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.69■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 OTOFQ9HC10 1997 aa22.69■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 ATP2B3Q16720 1220 aa22.68■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 SPRYD7Q5W111 196 aa22.68■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 TEKT1Q969V4 418 aa22.68■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 MAST3O60307 1309 aa22.67■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 MTX1Q13505 466 aa22.67■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.67■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.67■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.67■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 TEPSINQ96N21 525 aa22.67■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.67■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 SREBF2Q12772 1141 aa22.66■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 ZBTB22O15209 634 aa22.65■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 TNNI2P48788 182 aa22.65■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 DGKZQ13574 1117 aa22.65■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.65■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.65■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 TNNQ9UQP3 1299 aa22.65■■□□□ 1.22
TM2D1-211ENST00000496465 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.64■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 SRGAP3O43295 1099 aa22.64■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.63■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.63■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 WNK4Q96J92 1243 aa22.63■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.63■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.63■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 SEMA3EO15041 775 aa22.62■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 INHBEP58166 350 aa22.62■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.62■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.62■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.61■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 TBC1D8O95759 1140 aa22.61■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 GNAI2P04899 355 aa22.61■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 PHKA1P46020 1223 aa22.61■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.61■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 FAM83AQ86UY5 434 aa22.61■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 MYH2Q9UKX2 1941 aa22.61■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.6■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.6■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.59■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 ALDH1A1P00352 501 aa22.59■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 ADORA1P30542 326 aa22.59■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 CACNB3P54284 484 aa22.59■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 CCDC102BQ68D86 513 aa22.59■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.59■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 PRDX5P30044 214 aa22.58■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 TIMM10P62072 90 aa22.58■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 TFCP2Q12800 502 aa22.58■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.58■■□□□ 1.21
TM2D1-211ENST00000496465 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.57■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 AK9Q5TCS8 1911 aa22.57■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 GPR25O00155 361 aa22.57■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 GJA5P36382 358 aa22.57■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 IFNL1Q8IU54 200 aa22.57■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.57■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.56■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 A0A1B0GUL7 405 aa22.56■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.56■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 MAP3K9P80192 1104 aa22.55■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 HOOK2Q96ED9 719 aa22.55■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 XAGE2Q96GT9 111 aa22.55■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 ELP3Q9H9T3 547 aa22.55■■□□□ 1.2
TM2D1-211ENST00000496465 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
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