RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
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NELFE-212ENST00000492539 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.05■■□□□ 1.6
NELFE-212ENST00000492539 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.05■■□□□ 1.6
NELFE-212ENST00000492539 PTPRCP08575 1304 aa25.05■■□□□ 1.6
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NELFE-212ENST00000492539 PDE8BO95263 885 aa25.03■■□□□ 1.6
NELFE-212ENST00000492539 METTL24Q5JXM2 366 aa25.03■■□□□ 1.6
NELFE-212ENST00000492539 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.03■■□□□ 1.6
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NELFE-212ENST00000492539 ELP3Q9H9T3 547 aa25.03■■□□□ 1.6
NELFE-212ENST00000492539 TRIM17Q9Y577 477 aa25.03■■□□□ 1.6
NELFE-212ENST00000492539 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.03■■□□□ 1.6
NELFE-212ENST00000492539 CENPFP49454 3210 aa25.03■■□□□ 1.6
NELFE-212ENST00000492539 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.02■■□□□ 1.6
NELFE-212ENST00000492539 TNNI2P48788 182 aa25.02■■□□□ 1.6
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NELFE-212ENST00000492539 OPTNQ96CV9 577 aa25.02■■□□□ 1.6
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NELFE-212ENST00000492539 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.01■■□□□ 1.59
NELFE-212ENST00000492539 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.01■■□□□ 1.59
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NELFE-212ENST00000492539 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25■■□□□ 1.598e-8■□□□□ 9.6
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NELFE-212ENST00000492539 USP44Q9H0E7 712 aa25■■□□□ 1.59
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NELFE-212ENST00000492539 SSH1Q8WYL5 1049 aa24.99■■□□□ 1.59
NELFE-212ENST00000492539 KIF16BQ96L93 1317 aa24.99■■□□□ 1.59
NELFE-212ENST00000492539 FGFR2P21802 821 aa24.98■■□□□ 1.59
NELFE-212ENST00000492539 VGLL4Q14135 290 aa24.98■■□□□ 1.59
NELFE-212ENST00000492539 MIER1Q8N108 512 aa24.98■■□□□ 1.59
NELFE-212ENST00000492539 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.98■■□□□ 1.59
NELFE-212ENST00000492539 TEKT1Q969V4 418 aa24.98■■□□□ 1.59
NELFE-212ENST00000492539 MRIQ9BWK5 157 aa24.98■■□□□ 1.59
NELFE-212ENST00000492539 E9PSI1 815 aa24.97■■□□□ 1.59
NELFE-212ENST00000492539 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
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NELFE-212ENST00000492539 MAP3K9P80192 1104 aa24.97■■□□□ 1.59
NELFE-212ENST00000492539 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.97■■□□□ 1.59
NELFE-212ENST00000492539 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.97■■□□□ 1.59
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NELFE-212ENST00000492539 BRI3BPQ8WY22 251 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-212ENST00000492539 ZDHHC15Q96MV8 337 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-212ENST00000492539 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa24.96■■□□□ 1.59
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NELFE-212ENST00000492539 CAP1Q01518 475 aa24.94■■□□□ 1.58
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NELFE-212ENST00000492539 CSADQ9Y600 493 aa24.94■■□□□ 1.58
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NELFE-212ENST00000492539 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa24.93■■□□□ 1.58
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NELFE-212ENST00000492539 SLFN5Q08AF3 891 aa24.93■■□□□ 1.58
NELFE-212ENST00000492539 CCL15Q16663 113 aa24.93■■□□□ 1.58
NELFE-212ENST00000492539 FKBP1CQ5VVH2 108 aa24.93■■□□□ 1.58
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NELFE-212ENST00000492539 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.92■■□□□ 1.58
NELFE-212ENST00000492539 HHIPL2Q6UWX4 724 aa24.92■■□□□ 1.58
NELFE-212ENST00000492539 OTUD5Q96G74 571 aa24.92■■□□□ 1.58
NELFE-212ENST00000492539 TMOD2Q9NZR1 351 aa24.92■■□□□ 1.58
NELFE-212ENST00000492539 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa24.92■■□□□ 1.58
NELFE-212ENST00000492539 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
NELFE-212ENST00000492539 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.91■■□□□ 1.58
NELFE-212ENST00000492539 ARMC5Q96C12 935 aa24.91■■□□□ 1.58
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NELFE-212ENST00000492539 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
NELFE-212ENST00000492539 LPIN2Q92539 896 aa24.9■■□□□ 1.58
NELFE-212ENST00000492539 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24.9■■□□□ 1.58
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NELFE-212ENST00000492539 WRNIP1Q96S55 665 aa24.89■■□□□ 1.58
NELFE-212ENST00000492539 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.88■■□□□ 1.57
NELFE-212ENST00000492539 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
NELFE-212ENST00000492539 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
NELFE-212ENST00000492539 PCDH10Q9P2E7 1040 aa24.87■■□□□ 1.57
NELFE-212ENST00000492539 FBXO3Q9UK99 471 aa24.87■■□□□ 1.57
NELFE-212ENST00000492539 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa24.86■■□□□ 1.57
NELFE-212ENST00000492539 CETPP11597 493 aa24.86■■□□□ 1.57
NELFE-212ENST00000492539 DCAF15Q66K64 600 aa24.86■■□□□ 1.57
NELFE-212ENST00000492539 SMC4Q9NTJ3 1288 aa24.86■■□□□ 1.57
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