RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		21.46	■■□□□ 1.03
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		21.45	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	GNAI2	P04899	355 aa		21.45	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	MS4A1	P11836	297 aa		21.45	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	CRK	P46108	304 aa		21.45	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP2B3	Q16720	1220 aa		21.45	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TEKT1	Q969V4	418 aa		21.45	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		21.45	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		21.45	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TM4SF4	P48230	202 aa		21.44	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TNNI2	P48788	182 aa		21.44	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	INHBE	P58166	350 aa		21.44	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	21.44	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		21.44	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		21.44	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	21.44	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	21.44	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		21.44	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	RASA3	Q14644	834 aa		21.43	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	21.43	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	21.43	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	JAG2	Q9Y219	1238 aa		21.43	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SRGAP3	O43295	1099 aa		21.42	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	21.42	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF186	Q9NXI6	227 aa		21.42	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		21.42	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		21.41	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	CLRN2	A0PK11	232 aa		21.41	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	21.41	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SREBF2	Q12772	1141 aa		21.41	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	21.41	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM83A	Q86UY5	434 aa		21.41	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	HOOK2	Q96ED9	719 aa		21.41	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		21.41	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SIL1	Q9H173	461 aa		21.41	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	VEZT	Q9HBM0	779 aa		21.41	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		21.41	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	MOB2	Q70IA6	237 aa		21.4	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		21.4	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	21.4	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	21.4	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	21.4	■■□□□ 1.02
HDAC10-216	ENST00000489424	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		21.39	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	21.39	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	21.38	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	ALDH1A1	P00352	501 aa		21.38	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	21.38	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	SPRYD7	Q5W111	196 aa		21.38	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	21.38	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		21.38	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	TEPSIN	Q96N21	525 aa		21.38	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		21.38	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	21.37	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	IGSF3	O75054	1194 aa		21.37	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	TRPA1	O75762	1119 aa		21.37	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	21.37	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	GRIK5	Q16478	980 aa		21.37	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		21.37	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		21.37	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR108	Q9NPR9	543 aa		21.37	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC102B	Q68D86	513 aa		21.36	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	AOX1	Q06278	1338 aa		21.35	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	21.35	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	21.35	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	POLA2	Q14181	598 aa		21.35	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	21.35	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	SLF2	Q8IX21	1173 aa		21.35	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	SSH3	Q8TE77	659 aa		21.35	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	21.35	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	ABHD8	Q96I13	439 aa		21.35	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		21.35	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	21.35	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1B0GUL7	405 aa		21.34	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	21.34	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP8B2	P98198	1209 aa		21.34	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	PHKA1	P46020	1223 aa		21.33	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	TIMM10	P62072	90 aa		21.33	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	TFCP2	Q12800	502 aa		21.33	■■□□□ 1.01
HDAC10-216	ENST00000489424	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		21.32	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		21.32	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	21.32	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	PRKG1	Q13976	671 aa		21.32	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	XAGE2	Q96GT9	111 aa		21.32	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	WNK4	Q96J92	1243 aa		21.32	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	21.32	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	TNN	Q9UQP3	1299 aa		21.32	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP3K9	P80192	1104 aa		21.31	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		21.31	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM151A	Q8WW52	585 aa		21.31	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		21.31	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		21.31	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	PRDX5	P30044	214 aa		21.3	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	DCAF15	Q66K64	600 aa		21.3	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		21.3	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	21.3	■■□□□ 1
HDAC10-216	ENST00000489424	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1

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