RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484305.1

HDAC1-209, Transcript of histone deacetylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC1, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1-209ENST00000484305 UBE2Q2LH0YL09 131 aa15.98■□□□□ 0.15
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HDAC1-209ENST00000484305 GPR108Q9NPR9 543 aa15.9■□□□□ 0.14
HDAC1-209ENST00000484305 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa15.9■□□□□ 0.14
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HDAC1-209ENST00000484305 ABCF2Q9UG63 623 aa15.9■□□□□ 0.14
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HDAC1-209ENST00000484305 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
HDAC1-209ENST00000484305 SPATA5Q8NB90 893 aa15.89■□□□□ 0.13
HDAC1-209ENST00000484305 CLMNQ96JQ2 1002 aa15.89■□□□□ 0.13
HDAC1-209ENST00000484305 TMOD2Q9NZR1 351 aa15.89■□□□□ 0.13
HDAC1-209ENST00000484305 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa15.89■□□□□ 0.13
HDAC1-209ENST00000484305 MCAMP43121 646 aa15.88■□□□□ 0.13
HDAC1-209ENST00000484305 FKBP1CQ5VVH2 108 aa15.88■□□□□ 0.13
HDAC1-209ENST00000484305 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa15.88■□□□□ 0.13
HDAC1-209ENST00000484305 SLC10A4Q96EP9 437 aa15.88■□□□□ 0.13
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