RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480416.1

TNS1-215, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 335 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-215ENST00000480416 GGNBP2Q9H3C7 697 aa4.6□□□□□ -1.67
TNS1-215ENST00000480416 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa4.6□□□□□ -1.67
TNS1-215ENST00000480416 SPG7Q9UQ90 795 aa4.6□□□□□ -1.67
TNS1-215ENST00000480416 SHTN1A0MZ66 631 aa4.59□□□□□ -1.67
TNS1-215ENST00000480416 SRGNP10124 158 aa4.59□□□□□ -1.67
TNS1-215ENST00000480416 RFC5P40937 340 aa4.59□□□□□ -1.67
TNS1-215ENST00000480416 IARSP41252 1262 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TNS1-215ENST00000480416 HUNKP57058 714 aa4.59□□□□□ -1.67
TNS1-215ENST00000480416 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TNS1-215ENST00000480416 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
TNS1-215ENST00000480416 TJP1Q07157 1748 aa4.59□□□□□ -1.67
TNS1-215ENST00000480416 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TNS1-215ENST00000480416 NOGQ13253 232 aa4.59□□□□□ -1.67
TNS1-215ENST00000480416 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
TNS1-215ENST00000480416 Q6ZVU0 165 aa4.59□□□□□ -1.67
TNS1-215ENST00000480416 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa4.59□□□□□ -1.67
TNS1-215ENST00000480416 ADAM32Q8TC27 787 aa4.59□□□□□ -1.67
TNS1-215ENST00000480416 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TNS1-215ENST00000480416 HHIPL1Q96JK4 782 aa4.59□□□□□ -1.67
TNS1-215ENST00000480416 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa4.59□□□□□ -1.67
TNS1-215ENST00000480416 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa4.59□□□□□ -1.67
TNS1-215ENST00000480416 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TNS1-215ENST00000480416 ZNF831Q5JPB2 1677 aa4.58□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 INSRP06213 1382 aa4.58□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 SOBPA7XYQ1 873 aa4.58□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 ERVV-2B6SEH9 535 aa4.58□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 H0YGN5 161 aa4.58□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 FYB1O15117 783 aa4.58□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 SPINT1O43278 529 aa4.58□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 PPFIA3O75145 1194 aa4.58□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 CANXP27824 592 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 PDE6BP35913 854 aa4.58□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 CABP4P57796 275 aa4.58□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 SLC39A6Q13433 755 aa4.58□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 NEUROD2Q15784 382 aa4.58□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 AKAP4Q5JQC9 854 aa4.58□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 RGMBQ6NW40 437 aa4.58□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 USP48Q86UV5 1035 aa4.58□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 CNKSR1Q969H4 720 aa4.58□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 MASTLQ96GX5 879 aa4.58□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 SAGE1Q9NXZ1 904 aa4.58□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 HDAC9Q9UKV0 1011 aa4.58□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa4.58□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 COL15A1P39059 1388 aa4.57□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 ERBB4Q15303 1308 aa4.57□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 AKAP11Q9UKA4 1901 aa4.57□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 CCDC93Q567U6 631 aa4.57□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 RNF20Q5VTR2 975 aa4.57□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 STYK1Q6J9G0 422 aa4.57□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 PGAP2Q9UHJ9 254 aa4.57□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 DNMT3LQ9UJW3 386 aa4.57□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa4.57□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 RTL1A6NKG5 1358 aa4.56□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 TONSLQ96HA7 1378 aa4.56□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 ZBBXA8MT70 800 aa4.56□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 EIF6P56537 245 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 CBLBQ13191 982 aa4.56□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 LCE2CQ5TA81 110 aa4.56□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 TRPM4Q8TD43 1214 aa4.56□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 LAMA3Q16787 3333 aa4.56□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 NCAPD2Q15021 1401 aa4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 FIGNL2A6NMB9 653 aa4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 GPR25O00155 361 aa4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 EGFRP00533 1210 aa4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 ADH1AP07327 375 aa4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 EIF5P55010 431 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 RAB15P59190 212 aa4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 RELBQ01201 579 aa4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 CAP1Q01518 475 aa4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 PTSQ03393 145 aa4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 SOGA3Q5TF21 947 aa4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 MOB2Q70IA6 237 aa4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 CDC37L1Q7L3B6 337 aa4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 JDP2Q8WYK2 163 aa4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 LGR6Q9HBX8 967 aa4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 PRM3Q9NNZ6 103 aa4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 TERF2IPQ9NYB0 399 aa4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 GPRC5DQ9NZD1 345 aa4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 HTTP42858 3142 aa4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 SNED1Q8TER0 1413 aa4.55□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 FLT4P35916 1363 aa4.54□□□□□ -1.68
TNS1-215ENST00000480416 EYSQ5T1H1 3165 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 144.6 ms