RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479589.5

NENF-204, Transcript of neudesin neurotrophic factor, humanhuman

TSL 2

Gene NENF, Length 845 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NENF-204ENST00000479589 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
NENF-204ENST00000479589 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
NENF-204ENST00000479589 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
NENF-204ENST00000479589 TSKSQ9UJT2 592 aa29.41■■■□□ 2.3
NENF-204ENST00000479589 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa29.4■■■□□ 2.3
NENF-204ENST00000479589 RLBP1P12271 317 aa29.4■■■□□ 2.3
NENF-204ENST00000479589 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
NENF-204ENST00000479589 SPDYE2Q495Y8 402 aa29.4■■■□□ 2.3
NENF-204ENST00000479589 ARMC9Q7Z3E5 817 aa29.4■■■□□ 2.3
NENF-204ENST00000479589 WDR66Q8TBY9 1149 aa29.4■■■□□ 2.3
NENF-204ENST00000479589 CA12O43570 354 aa29.39■■■□□ 2.3
NENF-204ENST00000479589 ADORA1P30542 326 aa29.39■■■□□ 2.3
NENF-204ENST00000479589 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
NENF-204ENST00000479589 TFCP2Q12800 502 aa29.39■■■□□ 2.3
NENF-204ENST00000479589 TEKT1Q969V4 418 aa29.39■■■□□ 2.3
NENF-204ENST00000479589 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa29.39■■■□□ 2.3
NENF-204ENST00000479589 MAST3O60307 1309 aa29.39■■■□□ 2.3
NENF-204ENST00000479589 PHKA1P46020 1223 aa29.38■■■□□ 2.29
NENF-204ENST00000479589 TNFAIP1Q13829 316 aa29.38■■■□□ 2.29
NENF-204ENST00000479589 AKAP2Q9Y2D5 859 aa29.38■■■□□ 2.29
NENF-204ENST00000479589 RASA3Q14644 834 aa29.37■■■□□ 2.29
NENF-204ENST00000479589 C1orf115Q9H7X2 142 aa29.37■■■□□ 2.29
NENF-204ENST00000479589 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
NENF-204ENST00000479589 SSC5DA1L4H1 1573 aa29.36■■■□□ 2.29
NENF-204ENST00000479589 TIMM10P62072 90 aa29.36■■■□□ 2.29
NENF-204ENST00000479589 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa29.36■■■□□ 2.29
NENF-204ENST00000479589 FZD1Q9UP38 647 aa29.36■■■□□ 2.29
NENF-204ENST00000479589 A0A1B0GUL7 405 aa29.35■■■□□ 2.29
NENF-204ENST00000479589 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP29.35■■■□□ 2.29
NENF-204ENST00000479589 CCDC102BQ68D86 513 aa29.35■■■□□ 2.29
NENF-204ENST00000479589 DENND2AQ9ULE3 1009 aa29.35■■■□□ 2.29
NENF-204ENST00000479589 TCP10L2B9ZVM9 353 aa29.34■■■□□ 2.29
NENF-204ENST00000479589 SEMA3EO15041 775 aa29.34■■■□□ 2.29
NENF-204ENST00000479589 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
NENF-204ENST00000479589 ZDHHC15Q96MV8 337 aa29.34■■■□□ 2.29
NENF-204ENST00000479589 MRIQ9BWK5 157 aa29.34■■■□□ 2.29
NENF-204ENST00000479589 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
NENF-204ENST00000479589 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
NENF-204ENST00000479589 PANK1Q8TE04 598 aa29.33■■■□□ 2.29
NENF-204ENST00000479589 XAGE2Q96GT9 111 aa29.33■■■□□ 2.29
NENF-204ENST00000479589 TNNI2P48788 182 aa29.32■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 NEUROD6Q96NK8 337 aa29.32■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 CSRNP1Q96S65 589 aa29.32■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 ATP8B2P98198 1209 aa29.31■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 POLA2Q14181 598 aa29.31■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 MVPQ14764 893 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 LDLRAD1Q5T700 205 aa29.31■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 HHIPL2Q6UWX4 724 aa29.31■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 LDHBP07195 334 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 PRDX5P30044 214 aa29.3■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 CACNB3P54284 484 aa29.3■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 TMOD2Q9NZR1 351 aa29.3■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 SALL1Q9NSC2 1324 aa29.29■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 RASGRF1Q13972 1273 aa29.29■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 MAP3K11Q16584 847 aa29.29■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 SSH3Q8TE77 659 aa29.29■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 TMEM39BQ9GZU3 492 aa29.29■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 MS4A1P11836 297 aa29.28■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 DIXDC1Q155Q3 683 aa29.28■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 GORABQ5T7V8 394 aa29.28■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 RNF186Q9NXI6 227 aa29.28■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 SAGE1Q9NXZ1 904 aa29.28■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 ZBTB22O15209 634 aa29.27■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 TRPA1O75762 1119 aa29.27■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 IREB2P48200 963 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 CDAN1Q8IWY9 1227 aa29.27■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 TEPSINQ96N21 525 aa29.27■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 AKAP11Q9UKA4 1901 aa29.27■■■□□ 2.28
NENF-204ENST00000479589 CAPN15O75808 1086 aa29.26■■■□□ 2.27
NENF-204ENST00000479589 SLC10A4Q96EP9 437 aa29.26■■■□□ 2.27
NENF-204ENST00000479589 RCAN3Q9UKA8 241 aa29.26■■■□□ 2.27
NENF-204ENST00000479589 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa29.26■■■□□ 2.27
NENF-204ENST00000479589 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
NENF-204ENST00000479589 USP2O75604 605 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
NENF-204ENST00000479589 SURF6O75683 361 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
NENF-204ENST00000479589 CLMNQ96JQ2 1002 aa29.25■■■□□ 2.27
NENF-204ENST00000479589 ABCF2Q9UG63 623 aa29.24■■■□□ 2.27
NENF-204ENST00000479589 SPRYD7Q5W111 196 aa29.23■■■□□ 2.27
NENF-204ENST00000479589 UNCXA6NJT0 531 aa29.22■■■□□ 2.27
NENF-204ENST00000479589 FKBP1CQ5VVH2 108 aa29.22■■■□□ 2.27
NENF-204ENST00000479589 CEP85Q6P2H3 762 aa29.22■■■□□ 2.27
NENF-204ENST00000479589 FAM83AQ86UY5 434 aa29.22■■■□□ 2.27
NENF-204ENST00000479589 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
NENF-204ENST00000479589 SREBF2Q12772 1141 aa29.21■■■□□ 2.27
NENF-204ENST00000479589 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa29.21■■■□□ 2.27
NENF-204ENST00000479589 TNNI3KQ59H18 835 aa29.2■■■□□ 2.26
NENF-204ENST00000479589 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
NENF-204ENST00000479589 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa29.2■■■□□ 2.26
NENF-204ENST00000479589 WNK4Q96J92 1243 aa29.2■■■□□ 2.26
NENF-204ENST00000479589 GPR108Q9NPR9 543 aa29.2■■■□□ 2.26
NENF-204ENST00000479589 HMG20BQ9P0W2 317 aa29.2■■■□□ 2.26
NENF-204ENST00000479589 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
NENF-204ENST00000479589 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms