RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479589.5

NENF-204, Transcript of neudesin neurotrophic factor, humanhuman

TSL 2

Gene NENF, Length 845 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NENF-204ENST00000479589 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.34■■■■■ 6.93
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NENF-204ENST00000479589 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.5■■■■■ 5.04
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NENF-204ENST00000479589 SMARCA2P51531 1590 aa45.18■■■■■ 4.82
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NENF-204ENST00000479589 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.91■■■■■ 4.78
NENF-204ENST00000479589 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.88■■■■■ 4.78
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NENF-204ENST00000479589 NESP48681 1621 aa44.39■■■■■ 4.7
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NENF-204ENST00000479589 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.18■■■■■ 4.66
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NENF-204ENST00000479589 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.46■■■■■ 4.55
NENF-204ENST00000479589 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.45■■■■■ 4.55
NENF-204ENST00000479589 WDR62O43379 1518 aa43.35■■■■■ 4.53
NENF-204ENST00000479589 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.24■■■■■ 4.51
NENF-204ENST00000479589 PRDM2Q13029 1718 aa43.23■■■■■ 4.51
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NENF-204ENST00000479589 ABCC8Q09428 1581 aa42.65■■■■■ 4.42
NENF-204ENST00000479589 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.63■■■■■ 4.41
NENF-204ENST00000479589 IFT140Q96RY7 1462 aa42.55■■■■■ 4.4
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NENF-204ENST00000479589 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.16■■■■■ 4.34
NENF-204ENST00000479589 OSCARQ8IYS5 282 aa42.15■■■■■ 4.34
NENF-204ENST00000479589 SOGA1O94964 1423 aa42.14■■■■■ 4.34
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NENF-204ENST00000479589 WDR97A6NE52 1622 aa41.89■■■■■ 4.3
NENF-204ENST00000479589 CHD1O14646 1710 aa41.81■■■■■ 4.28
NENF-204ENST00000479589 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.78■■■■■ 4.28
NENF-204ENST00000479589 FBLN2P98095 1184 aa41.75■■■■■ 4.27
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NENF-204ENST00000479589 TOP2BQ02880 1626 aa41.73■■■■■ 4.27
NENF-204ENST00000479589 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.73■■■■■ 4.27
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NENF-204ENST00000479589 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
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NENF-204ENST00000479589 CUL7Q14999 1698 aa40.75■■■■■ 4.11
NENF-204ENST00000479589 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.74■■■■■ 4.11
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NENF-204ENST00000479589 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.65■■■■■ 4.1
NENF-204ENST00000479589 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.58■■■■■ 4.09
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