RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GRIK5Q16478 980 aa32.75■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLMNQ96JQ2 1002 aa32.75■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IREB2P48200 963 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RGS19P49795 217 aa32.73■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP32.73■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP32.72■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 USP2O75604 605 aaPredicted RBP32.72■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP32.72■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP32.72■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WNK4Q96J92 1243 aa32.72■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC5A1P13866 664 aa32.71■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INHBEP58166 350 aa32.71■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LPIN2Q92539 896 aa32.71■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCP10L2B9ZVM9 353 aa32.7■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNNI2P48788 182 aa32.7■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP32.7■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATG9AQ7Z3C6 839 aa32.7■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TEKT1Q969V4 418 aa32.7■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HDAC5Q9UQL6 1122 aa32.7■■■□□ 2.83
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR25O00155 361 aa32.69■■■□□ 2.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RARSP54136 660 aaKnown RBP32.69■■■□□ 2.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP32.69■■■□□ 2.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa32.69■■■□□ 2.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CFHR5Q9BXR6 569 aa32.69■■■□□ 2.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXO3Q9UK99 471 aa32.69■■■□□ 2.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALDH1A1P00352 501 aa32.68■■■□□ 2.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TEPSINQ96N21 525 aa32.68■■■□□ 2.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIL1Q9H173 461 aa32.68■■■□□ 2.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa32.68■■■□□ 2.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CIAO1O76071 339 aa32.67■■■□□ 2.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRIQ9BWK5 157 aa32.67■■■□□ 2.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAST3O60307 1309 aa32.67■■■□□ 2.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM39BQ9GZU3 492 aa32.66■■■□□ 2.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFNL1Q8IU54 200 aa32.65■■■□□ 2.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDAN1Q8IWY9 1227 aa32.65■■■□□ 2.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZDHHC15Q96MV8 337 aa32.65■■■□□ 2.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEP126Q9P2H0 1117 aa32.65■■■□□ 2.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR66Q8TBY9 1149 aa32.64■■■□□ 2.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa32.64■■■□□ 2.82
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FKTNO75072 461 aa32.63■■■□□ 2.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP2B3Q16720 1220 aa32.63■■■□□ 2.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGAP45Q92619 1136 aa32.63■■■□□ 2.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MEIS3Q99687 375 aa32.63■■■□□ 2.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMOD2Q9NZR1 351 aa32.63■■■□□ 2.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYH13Q9UKX3 1938 aa32.63■■■□□ 2.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LAMB1P07942 1786 aa32.63■■■□□ 2.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OTOFQ9HC10 1997 aa32.62■■■□□ 2.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GJA5P36382 358 aa32.62■■■□□ 2.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CACNB3P54284 484 aa32.62■■■□□ 2.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ELP3Q9H9T3 547 aa32.62■■■□□ 2.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL15P40933 162 aaPredicted RBP32.61■■■□□ 2.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HHIPL2Q6UWX4 724 aa32.61■■■□□ 2.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP32.6■■■□□ 2.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP32.6■■■□□ 2.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FKBP1CQ5VVH2 108 aa32.59■■■□□ 2.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OPTNQ96CV9 577 aa32.59■■■□□ 2.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HPS5Q9UPZ3 1129 aa32.59■■■□□ 2.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP3K9P80192 1104 aa32.58■■■□□ 2.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa32.58■■■□□ 2.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP32.58■■■□□ 2.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM83AQ86UY5 434 aa32.58■■■□□ 2.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COPRSQ9NQ92 184 aa32.58■■■□□ 2.81
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNAI3P08754 354 aa32.57■■■□□ 2.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOX10P56693 466 aa32.56■■■□□ 2.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VGLL4Q14135 290 aa32.56■■■□□ 2.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP32.56■■■□□ 2.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSADQ9Y600 493 aa32.56■■■□□ 2.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP32.55■■■□□ 2.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HOOK2Q96ED9 719 aa32.55■■■□□ 2.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEMA3EO15041 775 aa32.53■■■□□ 2.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PHKA1P46020 1223 aa32.53■■■□□ 2.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DENND2AQ9ULE3 1009 aa32.53■■■□□ 2.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LDHBP07195 334 aaKnown RBP32.52■■■□□ 2.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRDX5P30044 214 aa32.52■■■□□ 2.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa32.52■■■□□ 2.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTPN18Q99952 460 aa32.52■■■□□ 2.8
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SRGAP3O43295 1099 aa32.51■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DIXDC1Q155Q3 683 aa32.51■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MS4A4AQ96JQ5 239 aa32.51■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa32.51■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SALL1Q9NSC2 1324 aa32.51■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP32.5■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM27P14373 513 aa32.5■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADORA1P30542 326 aa32.5■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRHR2Q13324 411 aa32.5■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP32.5■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCAR3O75815 825 aa32.49■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GTF2A2P52657 109 aa32.49■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTX1Q13505 466 aa32.49■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCAF15Q66K64 600 aa32.49■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC102BQ68D86 513 aa32.49■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa32.49■■■□□ 2.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OTUD5Q96G74 571 aa32.49■■■□□ 2.79
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