RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 LDLRAD1Q5T700 205 aa33.22■■■□□ 2.91
ODC1-204ENST00000446285 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP33.22■■■□□ 2.91
ODC1-204ENST00000446285 MRIQ9BWK5 157 aa33.22■■■□□ 2.91
ODC1-204ENST00000446285 SIL1Q9H173 461 aa33.22■■■□□ 2.91
ODC1-204ENST00000446285 RNF186Q9NXI6 227 aa33.22■■■□□ 2.91
ODC1-204ENST00000446285 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP33.22■■■□□ 2.91
ODC1-204ENST00000446285 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP33.21■■■□□ 2.91
ODC1-204ENST00000446285 BCAR3O75815 825 aa33.2■■■□□ 2.91
ODC1-204ENST00000446285 ATP2B3Q16720 1220 aa33.2■■■□□ 2.91
ODC1-204ENST00000446285 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP33.2■■■□□ 2.91
ODC1-204ENST00000446285 SSC5DA1L4H1 1573 aa33.19■■■□□ 2.9
ODC1-204ENST00000446285 MTX1Q13505 466 aa33.19■■■□□ 2.9
ODC1-204ENST00000446285 PRKG1Q13976 671 aa33.19■■■□□ 2.9
ODC1-204ENST00000446285 RASA3Q14644 834 aa33.19■■■□□ 2.9
ODC1-204ENST00000446285 WDR66Q8TBY9 1149 aa33.19■■■□□ 2.9
ODC1-204ENST00000446285 TEKT1Q969V4 418 aa33.19■■■□□ 2.9
ODC1-204ENST00000446285 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP33.19■■■□□ 2.9
ODC1-204ENST00000446285 AOX1Q06278 1338 aa33.19■■■□□ 2.9
ODC1-204ENST00000446285 TRPA1O75762 1119 aa33.18■■■□□ 2.9
ODC1-204ENST00000446285 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP33.18■■■□□ 2.9
ODC1-204ENST00000446285 TNNI2P48788 182 aa33.17■■■□□ 2.9
ODC1-204ENST00000446285 ZBTB22O15209 634 aa33.16■■■□□ 2.9
ODC1-204ENST00000446285 SREBF2Q12772 1141 aa33.16■■■□□ 2.9
ODC1-204ENST00000446285 GRIK5Q16478 980 aa33.16■■■□□ 2.9
ODC1-204ENST00000446285 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa33.16■■■□□ 2.9
ODC1-204ENST00000446285 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP33.16■■■□□ 2.9
ODC1-204ENST00000446285 SRGAP3O43295 1099 aa33.15■■■□□ 2.9
ODC1-204ENST00000446285 IREB2P48200 963 aaKnown RBP33.15■■■□□ 2.9
ODC1-204ENST00000446285 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP33.15■■■□□ 2.9
ODC1-204ENST00000446285 ABHD8Q96I13 439 aa33.15■■■□□ 2.9
ODC1-204ENST00000446285 ZDHHC15Q96MV8 337 aa33.15■■■□□ 2.9
ODC1-204ENST00000446285 SEMA3EO15041 775 aa33.14■■■□□ 2.9
ODC1-204ENST00000446285 GNAI2P04899 355 aa33.14■■■□□ 2.9
ODC1-204ENST00000446285 TM4SF4P48230 202 aa33.14■■■□□ 2.9
ODC1-204ENST00000446285 ZBED9Q6R2W3 1325 aa33.13■■■□□ 2.89
ODC1-204ENST00000446285 HHIPL2Q6UWX4 724 aa33.13■■■□□ 2.89
ODC1-204ENST00000446285 SLC10A4Q96EP9 437 aa33.13■■■□□ 2.89
ODC1-204ENST00000446285 SPRYD7Q5W111 196 aa33.12■■■□□ 2.89
ODC1-204ENST00000446285 TMOD2Q9NZR1 351 aa33.12■■■□□ 2.89
ODC1-204ENST00000446285 CLUAP1Q96AJ1 413 aa33.11■■■□□ 2.89
ODC1-204ENST00000446285 DENND2AQ9ULE3 1009 aa33.11■■■□□ 2.89
ODC1-204ENST00000446285 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP33.1■■■□□ 2.89
ODC1-204ENST00000446285 FKBP1CQ5VVH2 108 aa33.1■■■□□ 2.89
ODC1-204ENST00000446285 AKAP2Q9Y2D5 859 aa33.1■■■□□ 2.89
ODC1-204ENST00000446285 LAMB1P07942 1786 aa33.1■■■□□ 2.89
ODC1-204ENST00000446285 SALL1Q9NSC2 1324 aa33.09■■■□□ 2.89
ODC1-204ENST00000446285 TCP10L2B9ZVM9 353 aa33.09■■■□□ 2.89
ODC1-204ENST00000446285 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa33.09■■■□□ 2.89
ODC1-204ENST00000446285 TEPSINQ96N21 525 aa33.09■■■□□ 2.89
ODC1-204ENST00000446285 FZD1Q9UP38 647 aa33.09■■■□□ 2.89
ODC1-204ENST00000446285 USP2O75604 605 aaPredicted RBP33.08■■■□□ 2.89
ODC1-204ENST00000446285 INHBEP58166 350 aa33.08■■■□□ 2.89
ODC1-204ENST00000446285 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP33.08■■■□□ 2.89
ODC1-204ENST00000446285 TNNQ9UQP3 1299 aa33.08■■■□□ 2.89
ODC1-204ENST00000446285 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP33.07■■■□□ 2.88
ODC1-204ENST00000446285 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP33.07■■■□□ 2.88
ODC1-204ENST00000446285 FAM83AQ86UY5 434 aa33.07■■■□□ 2.88
ODC1-204ENST00000446285 TMEM57Q8N5G2 664 aa33.07■■■□□ 2.88
ODC1-204ENST00000446285 MCOLN1Q9GZU1 580 aa33.07■■■□□ 2.88
ODC1-204ENST00000446285 DGKZQ13574 1117 aa33.06■■■□□ 2.88
ODC1-204ENST00000446285 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP33.06■■■□□ 2.88
ODC1-204ENST00000446285 WNK4Q96J92 1243 aa33.06■■■□□ 2.88
ODC1-204ENST00000446285 ALDH1A1P00352 501 aa33.05■■■□□ 2.88
ODC1-204ENST00000446285 PHKA1P46020 1223 aa33.05■■■□□ 2.88
ODC1-204ENST00000446285 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
ODC1-204ENST00000446285 CCDC102BQ68D86 513 aa33.05■■■□□ 2.88
ODC1-204ENST00000446285 HOOK2Q96ED9 719 aa33.05■■■□□ 2.88
ODC1-204ENST00000446285 TMEM39BQ9GZU3 492 aa33.05■■■□□ 2.88
ODC1-204ENST00000446285 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
ODC1-204ENST00000446285 OTOFQ9HC10 1997 aa33.04■■■□□ 2.88
ODC1-204ENST00000446285 LDHBP07195 334 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
ODC1-204ENST00000446285 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP33.04■■■□□ 2.88
ODC1-204ENST00000446285 CLMNQ96JQ2 1002 aa33.04■■■□□ 2.88
ODC1-204ENST00000446285 CFHR5Q9BXR6 569 aa33.04■■■□□ 2.88
ODC1-204ENST00000446285 A0A1B0GUL7 405 aa33.03■■■□□ 2.88
ODC1-204ENST00000446285 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP33.03■■■□□ 2.88
ODC1-204ENST00000446285 ADORA1P30542 326 aa33.02■■■□□ 2.88
ODC1-204ENST00000446285 TFCP2Q12800 502 aa33.02■■■□□ 2.88
ODC1-204ENST00000446285 MVPQ14764 893 aaKnown RBP33.02■■■□□ 2.88
ODC1-204ENST00000446285 TIMM10P62072 90 aa33.01■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 PRDX5P30044 214 aa33■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP33■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 XAGE2Q96GT9 111 aa33■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa33■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 CACNB3P54284 484 aa32.99■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 CDAN1Q8IWY9 1227 aa32.99■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa32.98■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 TBC1D8O95759 1140 aa32.98■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 MAP3K9P80192 1104 aa32.98■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP32.98■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 RASGRF1Q13972 1273 aa32.97■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP32.97■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 CSADQ9Y600 493 aa32.97■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 DIXDC1Q155Q3 683 aa32.96■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP32.96■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa32.96■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 IFNL1Q8IU54 200 aa32.96■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 SLF2Q8IX21 1173 aa32.96■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP32.96■■■□□ 2.87
ODC1-204ENST00000446285 MYH2Q9UKX2 1941 aa32.95■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms