RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 SPDYE2BA6NHP3 402 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-205ENST00000444916 SPDYE6P0CI01 402 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-205ENST00000444916 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-205ENST00000444916 C1orf115Q9H7X2 142 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-205ENST00000444916 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-205ENST00000444916 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
SH3BP4-205ENST00000444916 POLA2Q14181 598 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-205ENST00000444916 SERPINA10Q9UK55 444 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-205ENST00000444916 AKAP2Q9Y2D5 859 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-205ENST00000444916 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP4-205ENST00000444916 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 MYO1BO43795 1136 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 ATP8B2P98198 1209 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 TFCP2Q12800 502 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 SSH3Q8TE77 659 aa17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 PHKA1P46020 1223 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP17.5■□□□□ 0.398e-6■■■□□ 15.8
SH3BP4-205ENST00000444916 GRIK5Q16478 980 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 MOB2Q70IA6 237 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa17.5■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 A0A1B0GUL7 405 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 SEMA3EO15041 775 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 ZBTB22O15209 634 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 ADORA1P30542 326 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 TIMM10P62072 90 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 FKBP1BP68106 108 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 MVPQ14764 893 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC102BQ68D86 513 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 RASAL3Q86YV0 1011 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 WDR66Q8TBY9 1149 aa17.49■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 MAST3O60307 1309 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 CLRN2A0PK11 232 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 CRKP46108 304 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 DENND2AQ9ULE3 1009 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 DDX19BQ9UMR2 479 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 HPS5Q9UPZ3 1129 aa17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 AOX1Q06278 1338 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 NF2P35240 595 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 SPDYE2Q495Y8 402 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 CEP85Q6P2H3 762 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 TEKT1Q969V4 418 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 XAGE2Q96GT9 111 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 MRIQ9BWK5 157 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 DEFB129Q9H1M3 183 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 VEZTQ9HBM0 779 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 COG6Q9Y2V7 657 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 SALL1Q9NSC2 1324 aa17.47■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
SH3BP4-205ENST00000444916 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 SURF6O75683 361 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 TBC1D8O95759 1140 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 RASGRF1Q13972 1273 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 ZDHHC15Q96MV8 337 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 NEUROD6Q96NK8 337 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 UBE2Q2LH0YL09 131 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 TNFAIP1Q13829 316 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 PDE3AQ14432 1141 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 GPR108Q9NPR9 543 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa17.44■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 LDHBP07195 334 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 PRDX5P30044 214 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 GORABQ5T7V8 394 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 HHIPL2Q6UWX4 724 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 SSC5DA1L4H1 1573 aa17.43■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 RASA3Q14644 834 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 TNNI3KQ59H18 835 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 ARMC9Q7Z3E5 817 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa17.42■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 MYH2Q9UKX2 1941 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 C20orf194Q5TEA3 1177 aa17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP17.41■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 TCP10L2B9ZVM9 353 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 TNNI2P48788 182 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 PRKG1Q13976 671 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 DIXDC1Q155Q3 683 aa17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
SH3BP4-205ENST00000444916 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms