RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.25■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 IFNKQ9P0W0 207 aa21.25■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 SMC2O95347 1197 aa21.24■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC24Q50LG9 513 aa21.24■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.24■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 BPIFA3Q9BQP9 254 aa21.24■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.24■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 KIAA1468Q9P260 1216 aa21.24■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 NEDD4P46934 1319 aa21.24■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 BIN1O00499 593 aa21.24■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 CYP2C19P33261 490 aa21.24■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 HAND2P61296 217 aa21.24■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 STK38Q15208 465 aa21.24■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 A1BGP04217 495 aa21.23■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 TUBB4AP04350 444 aa21.23■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.23■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.23■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa21.23■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 OSBP2Q969R2 916 aa21.23■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1W2PQ27 194 aa21.22■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1W2PQ64 194 aa21.22■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1W2PQD8 194 aa21.22■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 PLA2G4AP47712 749 aa21.22■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.22■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa21.22■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 C8orf76Q96K31 380 aa21.22■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 LTBP4Q8N2S1 1624 aa21.21■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1B0GUL7 405 aa21.21■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 H7C1W4 665 aa21.21■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.21■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
RALGPS1-208ENST00000424082 FOXP2O15409 715 aa21.2■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP21.2■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.2■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 GPR108Q9NPR9 543 aa21.2■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.2■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 SPTLC2O15270 562 aa21.19■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 NRDCO43847 1150 aa21.19■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 EVCP57679 992 aa21.19■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.19■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.19■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.19■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 ADAMTS2O95450 1211 aa21.19■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 ETF1P62495 437 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 GORABQ5T7V8 394 aa21.19■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 MYSM1Q5VVJ2 828 aa21.19■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 HOMER1Q86YM7 354 aa21.19■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.19■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 ASAP1Q9ULH1 1129 aa21.19■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa21.19■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa21.18■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.18■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 KIF28PB7ZC32 967 aa21.18■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF202O95125 648 aa21.18■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.18■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 ISM2Q6H9L7 571 aa21.18■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 TMOD3Q9NYL9 352 aa21.18■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.18■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 EYA2O00167 538 aa21.18■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 TULP2O00295 520 aa21.18■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 PIGBQ92521 554 aa21.18■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAI1Q9UI46 699 aa21.18■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 PRC1O43663 620 aa21.17■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 YEATS4O95619 227 aa21.17■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 NLRP12P59046 1061 aa21.17■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 TPM4P67936 248 aa21.17■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 NCAPHQ15003 741 aa21.17■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 WASHC4Q2M389 1173 aa21.17■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 FBXL16Q8N461 479 aa21.17■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 UBXN4Q92575 508 aa21.17■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 NWD2Q9ULI1 1742 aa21.17■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 PAPPAQ13219 1627 aa21.17■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 CCP110O43303 1012 aa21.17■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 TMCO3Q6UWJ1 677 aa21.17■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 KAT6BQ8WYB5 2073 aa21.16■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 TNS2Q63HR2 1409 aa21.16■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 FGAP02671 866 aa21.16■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.16■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa21.16■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 PFKFB1P16118 471 aa21.16■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
RALGPS1-208ENST00000424082 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.3 ms