RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 KARSQ15046 597 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
OPN3-201ENST00000366554 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
OPN3-201ENST00000366554 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
OPN3-201ENST00000366554 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
OPN3-201ENST00000366554 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
OPN3-201ENST00000366554 MED4Q9NPJ6 270 aa24.97■■□□□ 1.59
OPN3-201ENST00000366554 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.97■■□□□ 1.59
OPN3-201ENST00000366554 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.97■■□□□ 1.59
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OPN3-201ENST00000366554 TUBB4BP68371 445 aa24.96■■□□□ 1.59
OPN3-201ENST00000366554 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
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OPN3-201ENST00000366554 PPFIA3O75145 1194 aa24.96■■□□□ 1.59
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OPN3-201ENST00000366554 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
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OPN3-201ENST00000366554 FAM204AQ9H8W3 233 aa24.96■■□□□ 1.59
OPN3-201ENST00000366554 PHACTR2O75167 634 aa24.95■■□□□ 1.58
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OPN3-201ENST00000366554 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa24.95■■□□□ 1.58
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OPN3-201ENST00000366554 FLT4P35916 1363 aa24.94■■□□□ 1.58
OPN3-201ENST00000366554 PRR29P0C7W0 189 aa24.93■■□□□ 1.58
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OPN3-201ENST00000366554 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
OPN3-201ENST00000366554 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.92■■□□□ 1.58
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OPN3-201ENST00000366554 GBP3Q9H0R5 595 aa24.92■■□□□ 1.58
OPN3-201ENST00000366554 CEP83Q9Y592 693 aa24.92■■□□□ 1.58
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OPN3-201ENST00000366554 TUBB2AQ13885 445 aa24.92■■□□□ 1.58
OPN3-201ENST00000366554 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa24.92■■□□□ 1.58
OPN3-201ENST00000366554 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.92■■□□□ 1.58
OPN3-201ENST00000366554 TUBB2BQ9BVA1 445 aa24.92■■□□□ 1.58
OPN3-201ENST00000366554 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.92■■□□□ 1.58
OPN3-201ENST00000366554 MYSM1Q5VVJ2 828 aa24.91■■□□□ 1.58
OPN3-201ENST00000366554 MICALL1Q8N3F8 863 aa24.91■■□□□ 1.58
OPN3-201ENST00000366554 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa24.91■■□□□ 1.58
OPN3-201ENST00000366554 ACEP12821 1306 aa24.91■■□□□ 1.58
OPN3-201ENST00000366554 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.91■■□□□ 1.58
OPN3-201ENST00000366554 CCDC175P0C221 793 aa24.91■■□□□ 1.58
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OPN3-201ENST00000366554 KAT2BQ92831 832 aa24.9■■□□□ 1.58
OPN3-201ENST00000366554 ZNF609O15014 1411 aa24.9■■□□□ 1.58
OPN3-201ENST00000366554 TUBBP07437 444 aa24.9■■□□□ 1.58
OPN3-201ENST00000366554 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa24.9■■□□□ 1.58
OPN3-201ENST00000366554 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
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OPN3-201ENST00000366554 METP08581 1390 aa24.9■■□□□ 1.58
OPN3-201ENST00000366554 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
OPN3-201ENST00000366554 HOXB7P09629 217 aa24.89■■□□□ 1.58
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OPN3-201ENST00000366554 ACBD3Q9H3P7 528 aa24.89■■□□□ 1.58
OPN3-201ENST00000366554 RNF40O75150 1001 aa24.89■■□□□ 1.57
OPN3-201ENST00000366554 ANXA1P04083 346 aa24.89■■□□□ 1.57
OPN3-201ENST00000366554 CHGBP05060 677 aa24.89■■□□□ 1.57
OPN3-201ENST00000366554 RHOXF2BP0C7M4 288 aa24.89■■□□□ 1.57
OPN3-201ENST00000366554 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.57
OPN3-201ENST00000366554 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
OPN3-201ENST00000366554 RHOXF2Q9BQY4 288 aa24.89■■□□□ 1.57
OPN3-201ENST00000366554 RAPGEF3O95398 923 aa24.88■■□□□ 1.57
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OPN3-201ENST00000366554 APPP05067 770 aa24.88■■□□□ 1.57
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OPN3-201ENST00000366554 LZTFL1Q9NQ48 299 aa24.88■■□□□ 1.57
OPN3-201ENST00000366554 DONSONQ9NYP3 566 aa24.88■■□□□ 1.57
OPN3-201ENST00000366554 HPSEQ9Y251 543 aa24.88■■□□□ 1.57
OPN3-201ENST00000366554 USP6P35125 1406 aa24.88■■□□□ 1.57
OPN3-201ENST00000366554 AFAP1L1Q8TED9 768 aa24.88■■□□□ 1.57
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OPN3-201ENST00000366554 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.87■■□□□ 1.57
OPN3-201ENST00000366554 ANO1Q5XXA6 986 aa24.87■■□□□ 1.57
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OPN3-201ENST00000366554 ARHGEF25Q86VW2 580 aa24.87■■□□□ 1.57
OPN3-201ENST00000366554 ADGRG1Q9Y653 693 aa24.87■■□□□ 1.57
OPN3-201ENST00000366554 KIF5CO60282 957 aa24.86■■□□□ 1.57
OPN3-201ENST00000366554 ERLIN2O94905 339 aa24.86■■□□□ 1.57
OPN3-201ENST00000366554 RFX7Q2KHR2 1363 aa24.86■■□□□ 1.57
OPN3-201ENST00000366554 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
OPN3-201ENST00000366554 LAMA4Q16363 1823 aa24.86■■□□□ 1.57
OPN3-201ENST00000366554 A0A0U1RQJ8 604 aa24.85■■□□□ 1.57
OPN3-201ENST00000366554 SOWAHDA6NJG2 315 aa24.85■■□□□ 1.57
OPN3-201ENST00000366554 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
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