RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 AOX1Q06278 1338 aa22.47■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 SLC5A1P13866 664 aa22.47■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 GRIK5Q16478 980 aa22.47■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.47■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 FKBP1BP68106 108 aa22.46■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 ZIC5Q96T25 663 aa22.46■■□□□ 1.19
PTX4-201ENST00000293922 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.45■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.45■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 ATP2B3Q16720 1220 aa22.45■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.45■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.45■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 NOGQ13253 232 aa22.44■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.44■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 IFFO2Q5TF58 517 aa22.44■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 MOB2Q70IA6 237 aa22.44■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.44■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 CLRN2A0PK11 232 aa22.43■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 RAB11FIP3O75154 756 aa22.43■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 CCDC102AQ96A19 550 aa22.43■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.43■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 MYO1BO43795 1136 aa22.42■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 SLC10A3P09131 477 aa22.41■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 LBX1P52954 281 aa22.41■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 PRDM10Q9NQV6 1147 aa22.41■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.4■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 NF2P35240 595 aa22.4■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 CRKP46108 304 aa22.4■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.4■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.4■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 VEZTQ9HBM0 779 aa22.4■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.4■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 NUCB1Q02818 461 aa22.4■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 SPDYE2Q495Y8 402 aa22.4■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.4■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.4■■□□□ 1.18
PTX4-201ENST00000293922 ADORA1P30542 326 aa22.39■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 PHKA1P46020 1223 aa22.39■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 TFCP2Q12800 502 aa22.39■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.39■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.39■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.38■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.38■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.38■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.38■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.38■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 TIMM10P62072 90 aa22.37■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 PRKG1Q13976 671 aa22.37■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.37■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 TNS4Q8IZW8 715 aa22.37■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 MRIQ9BWK5 157 aa22.37■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 APBB1O00213 710 aa22.36■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 ZBTB22O15209 634 aa22.36■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 RASA3Q14644 834 aa22.36■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 CCDC102BQ68D86 513 aa22.36■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 TEKT1Q969V4 418 aa22.36■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 TSKSQ9UJT2 592 aa22.36■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 FZD1Q9UP38 647 aa22.36■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 A0A1B0GUL7 405 aa22.35■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 CA12O43570 354 aa22.35■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.35■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.35■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.35■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 MAST3O60307 1309 aa22.34■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 TNFAIP1Q13829 316 aa22.34■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.34■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 SEMA3EO15041 775 aa22.33■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 XAGE2Q96GT9 111 aa22.33■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 CSRNP1Q96S65 589 aa22.33■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 LNPKQ9C0E8 428 aa22.33■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.33■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.33■■□□□ 1.17
PTX4-201ENST00000293922 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.33■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 PRDX5P30044 214 aa22.32■■□□□ 1.16
PTX4-201ENST00000293922 MAP3K11Q16584 847 aa22.32■■□□□ 1.16
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